Protein–RNA interactions for Protein: P59016

Vps33b, Vacuolar protein sorting-associated protein 33B, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps33bP59016 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vps33bP59016 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vps33bP59016 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vps33bP59016 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vps33bP59016 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vps33bP59016 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vps33bP59016 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vps33bP59016 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vps33bP59016 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vps33bP59016 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vps33bP59016 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vps33bP59016 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vps33bP59016 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vps33bP59016 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Vps33bP59016 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Vps33bP59016 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Vps33bP59016 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Vps33bP59016 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Vps33bP59016 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Vps33bP59016 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Vps33bP59016 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Vps33bP59016 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Vps33bP59016 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Vps33bP59016 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Vps33bP59016 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Vps33bP59016 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Vps33bP59016 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Vps33bP59016 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Vps33bP59016 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Vps33bP59016 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Vps33bP59016 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Vps33bP59016 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Vps33bP59016 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Vps33bP59016 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Vps33bP59016 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Vps33bP59016 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Vps33bP59016 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Vps33bP59016 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Vps33bP59016 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Vps33bP59016 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Vps33bP59016 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Vps33bP59016 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Vps33bP59016 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Vps33bP59016 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Vps33bP59016 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Vps33bP59016 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Vps33bP59016 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Vps33bP59016 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Vps33bP59016 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Vps33bP59016 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Vps33bP59016 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Vps33bP59016 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Vps33bP59016 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Vps33bP59016 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Vps33bP59016 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Vps33bP59016 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Vps33bP59016 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Vps33bP59016 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vps33bP59016 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vps33bP59016 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vps33bP59016 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vps33bP59016 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vps33bP59016 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vps33bP59016 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vps33bP59016 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vps33bP59016 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vps33bP59016 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vps33bP59016 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vps33bP59016 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vps33bP59016 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vps33bP59016 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Vps33bP59016 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vps33bP59016 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vps33bP59016 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vps33bP59016 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vps33bP59016 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vps33bP59016 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vps33bP59016 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vps33bP59016 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vps33bP59016 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Vps33bP59016 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vps33bP59016 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vps33bP59016 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vps33bP59016 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vps33bP59016 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Vps33bP59016 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Vps33bP59016 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Vps33bP59016 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Vps33bP59016 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Vps33bP59016 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Vps33bP59016 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Vps33bP59016 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Vps33bP59016 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Vps33bP59016 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Vps33bP59016 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Vps33bP59016 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Vps33bP59016 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Vps33bP59016 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Vps33bP59016 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Vps33bP59016 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms