Protein–RNA interactions for Protein: P58465

Ctdspl, CTD small phosphatase-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtdsplP58465 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CtdsplP58465 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CtdsplP58465 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CtdsplP58465 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CtdsplP58465 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CtdsplP58465 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CtdsplP58465 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CtdsplP58465 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CtdsplP58465 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CtdsplP58465 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CtdsplP58465 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CtdsplP58465 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtdsplP58465 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtdsplP58465 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtdsplP58465 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtdsplP58465 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtdsplP58465 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtdsplP58465 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtdsplP58465 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtdsplP58465 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtdsplP58465 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CtdsplP58465 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtdsplP58465 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtdsplP58465 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtdsplP58465 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtdsplP58465 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtdsplP58465 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtdsplP58465 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtdsplP58465 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtdsplP58465 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtdsplP58465 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtdsplP58465 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CtdsplP58465 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtdsplP58465 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtdsplP58465 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtdsplP58465 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtdsplP58465 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtdsplP58465 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtdsplP58465 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtdsplP58465 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtdsplP58465 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtdsplP58465 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtdsplP58465 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtdsplP58465 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtdsplP58465 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtdsplP58465 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtdsplP58465 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtdsplP58465 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtdsplP58465 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtdsplP58465 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtdsplP58465 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtdsplP58465 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtdsplP58465 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CtdsplP58465 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CtdsplP58465 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CtdsplP58465 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CtdsplP58465 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CtdsplP58465 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CtdsplP58465 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CtdsplP58465 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CtdsplP58465 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CtdsplP58465 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CtdsplP58465 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CtdsplP58465 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CtdsplP58465 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CtdsplP58465 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CtdsplP58465 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CtdsplP58465 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CtdsplP58465 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CtdsplP58465 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CtdsplP58465 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CtdsplP58465 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CtdsplP58465 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CtdsplP58465 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtdsplP58465 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtdsplP58465 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtdsplP58465 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtdsplP58465 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtdsplP58465 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtdsplP58465 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtdsplP58465 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtdsplP58465 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CtdsplP58465 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtdsplP58465 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtdsplP58465 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtdsplP58465 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtdsplP58465 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtdsplP58465 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtdsplP58465 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtdsplP58465 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtdsplP58465 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtdsplP58465 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtdsplP58465 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtdsplP58465 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtdsplP58465 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtdsplP58465 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtdsplP58465 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtdsplP58465 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtdsplP58465 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtdsplP58465 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms