Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Samsn1P57725 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Samsn1P57725 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Samsn1P57725 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Samsn1P57725 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Samsn1P57725 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Samsn1P57725 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Samsn1P57725 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Samsn1P57725 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Samsn1P57725 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Samsn1P57725 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Samsn1P57725 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Samsn1P57725 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Samsn1P57725 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Samsn1P57725 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Samsn1P57725 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Samsn1P57725 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Samsn1P57725 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Samsn1P57725 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Samsn1P57725 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Samsn1P57725 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Samsn1P57725 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Samsn1P57725 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Samsn1P57725 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Samsn1P57725 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Samsn1P57725 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Samsn1P57725 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Samsn1P57725 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Samsn1P57725 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Samsn1P57725 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Samsn1P57725 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Samsn1P57725 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Samsn1P57725 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Samsn1P57725 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Samsn1P57725 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Samsn1P57725 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Samsn1P57725 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Samsn1P57725 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Samsn1P57725 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Samsn1P57725 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Samsn1P57725 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Samsn1P57725 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Samsn1P57725 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Samsn1P57725 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Samsn1P57725 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Samsn1P57725 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Samsn1P57725 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Samsn1P57725 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Samsn1P57725 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Samsn1P57725 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Samsn1P57725 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Samsn1P57725 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Samsn1P57725 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Samsn1P57725 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Samsn1P57725 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Samsn1P57725 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Samsn1P57725 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Samsn1P57725 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Samsn1P57725 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Samsn1P57725 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Samsn1P57725 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Samsn1P57725 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Samsn1P57725 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Samsn1P57725 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Samsn1P57725 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Samsn1P57725 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Samsn1P57725 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Samsn1P57725 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Samsn1P57725 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Samsn1P57725 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Samsn1P57725 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Samsn1P57725 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Samsn1P57725 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Samsn1P57725 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Samsn1P57725 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Samsn1P57725 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Samsn1P57725 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Samsn1P57725 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Samsn1P57725 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Samsn1P57725 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Samsn1P57725 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Samsn1P57725 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Samsn1P57725 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Samsn1P57725 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Samsn1P57725 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Samsn1P57725 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Samsn1P57725 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Samsn1P57725 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Samsn1P57725 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Samsn1P57725 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Samsn1P57725 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Samsn1P57725 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Samsn1P57725 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Samsn1P57725 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Samsn1P57725 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Samsn1P57725 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Samsn1P57725 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Samsn1P57725 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Samsn1P57725 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Samsn1P57725 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms