Protein–RNA interactions for Protein: P56528

Cd38, ADP-ribosyl cyclase/cyclic ADP-ribose hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd38P56528 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd38P56528 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd38P56528 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd38P56528 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd38P56528 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd38P56528 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd38P56528 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd38P56528 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd38P56528 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd38P56528 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd38P56528 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd38P56528 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd38P56528 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd38P56528 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd38P56528 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd38P56528 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd38P56528 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd38P56528 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd38P56528 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd38P56528 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd38P56528 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Cd38P56528 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cd38P56528 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cd38P56528 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cd38P56528 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cd38P56528 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cd38P56528 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cd38P56528 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cd38P56528 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cd38P56528 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cd38P56528 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cd38P56528 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cd38P56528 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cd38P56528 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cd38P56528 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cd38P56528 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cd38P56528 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Cd38P56528 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cd38P56528 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cd38P56528 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cd38P56528 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cd38P56528 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cd38P56528 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cd38P56528 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cd38P56528 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cd38P56528 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cd38P56528 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cd38P56528 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cd38P56528 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cd38P56528 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Cd38P56528 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cd38P56528 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cd38P56528 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Cd38P56528 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cd38P56528 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cd38P56528 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Cd38P56528 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cd38P56528 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cd38P56528 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cd38P56528 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cd38P56528 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cd38P56528 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cd38P56528 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cd38P56528 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cd38P56528 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cd38P56528 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Cd38P56528 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cd38P56528 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cd38P56528 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cd38P56528 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cd38P56528 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cd38P56528 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cd38P56528 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cd38P56528 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cd38P56528 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cd38P56528 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cd38P56528 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cd38P56528 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cd38P56528 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cd38P56528 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cd38P56528 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cd38P56528 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cd38P56528 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd38P56528 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd38P56528 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd38P56528 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd38P56528 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd38P56528 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd38P56528 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd38P56528 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd38P56528 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd38P56528 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd38P56528 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd38P56528 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd38P56528 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cd38P56528 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cd38P56528 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cd38P56528 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cd38P56528 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cd38P56528 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms