Protein–RNA interactions for Protein: P56475

Gabrr1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit rho-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrr1P56475 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabrr1P56475 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabrr1P56475 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabrr1P56475 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabrr1P56475 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabrr1P56475 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabrr1P56475 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabrr1P56475 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabrr1P56475 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabrr1P56475 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabrr1P56475 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabrr1P56475 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabrr1P56475 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabrr1P56475 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabrr1P56475 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabrr1P56475 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabrr1P56475 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabrr1P56475 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabrr1P56475 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabrr1P56475 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabrr1P56475 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabrr1P56475 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabrr1P56475 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabrr1P56475 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabrr1P56475 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabrr1P56475 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabrr1P56475 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabrr1P56475 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabrr1P56475 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabrr1P56475 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabrr1P56475 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabrr1P56475 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabrr1P56475 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabrr1P56475 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabrr1P56475 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabrr1P56475 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabrr1P56475 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabrr1P56475 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabrr1P56475 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabrr1P56475 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabrr1P56475 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabrr1P56475 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabrr1P56475 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabrr1P56475 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gabrr1P56475 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gabrr1P56475 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gabrr1P56475 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gabrr1P56475 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabrr1P56475 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabrr1P56475 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabrr1P56475 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabrr1P56475 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabrr1P56475 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabrr1P56475 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabrr1P56475 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabrr1P56475 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabrr1P56475 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabrr1P56475 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabrr1P56475 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabrr1P56475 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabrr1P56475 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabrr1P56475 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabrr1P56475 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabrr1P56475 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabrr1P56475 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabrr1P56475 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabrr1P56475 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabrr1P56475 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabrr1P56475 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabrr1P56475 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabrr1P56475 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabrr1P56475 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabrr1P56475 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabrr1P56475 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabrr1P56475 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabrr1P56475 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabrr1P56475 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabrr1P56475 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabrr1P56475 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabrr1P56475 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabrr1P56475 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabrr1P56475 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabrr1P56475 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabrr1P56475 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabrr1P56475 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabrr1P56475 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabrr1P56475 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabrr1P56475 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabrr1P56475 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabrr1P56475 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabrr1P56475 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabrr1P56475 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabrr1P56475 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabrr1P56475 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabrr1P56475 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabrr1P56475 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabrr1P56475 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabrr1P56475 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabrr1P56475 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabrr1P56475 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms