Protein–RNA interactions for Protein: P56390

Cks2, Cyclin-dependent kinases regulatory subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cks2P56390 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cks2P56390 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cks2P56390 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cks2P56390 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cks2P56390 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cks2P56390 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cks2P56390 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cks2P56390 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cks2P56390 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cks2P56390 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cks2P56390 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cks2P56390 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cks2P56390 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cks2P56390 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cks2P56390 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cks2P56390 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cks2P56390 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cks2P56390 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cks2P56390 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cks2P56390 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cks2P56390 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cks2P56390 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cks2P56390 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cks2P56390 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cks2P56390 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cks2P56390 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cks2P56390 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cks2P56390 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cks2P56390 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cks2P56390 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cks2P56390 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cks2P56390 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cks2P56390 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cks2P56390 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cks2P56390 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cks2P56390 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cks2P56390 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cks2P56390 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cks2P56390 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cks2P56390 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cks2P56390 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cks2P56390 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cks2P56390 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cks2P56390 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cks2P56390 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cks2P56390 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cks2P56390 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cks2P56390 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cks2P56390 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cks2P56390 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cks2P56390 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cks2P56390 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cks2P56390 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cks2P56390 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cks2P56390 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cks2P56390 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cks2P56390 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cks2P56390 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cks2P56390 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cks2P56390 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cks2P56390 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cks2P56390 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cks2P56390 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cks2P56390 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cks2P56390 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cks2P56390 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cks2P56390 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cks2P56390 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cks2P56390 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cks2P56390 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cks2P56390 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cks2P56390 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cks2P56390 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cks2P56390 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cks2P56390 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cks2P56390 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cks2P56390 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cks2P56390 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cks2P56390 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cks2P56390 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cks2P56390 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cks2P56390 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cks2P56390 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cks2P56390 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cks2P56390 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cks2P56390 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cks2P56390 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cks2P56390 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cks2P56390 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cks2P56390 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cks2P56390 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cks2P56390 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cks2P56390 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cks2P56390 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cks2P56390 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cks2P56390 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cks2P56390 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cks2P56390 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cks2P56390 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cks2P56390 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms