Protein–RNA interactions for Protein: P56389

Cda, Cytidine deaminase, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CdaP56389 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CdaP56389 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CdaP56389 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CdaP56389 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CdaP56389 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CdaP56389 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CdaP56389 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CdaP56389 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CdaP56389 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CdaP56389 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CdaP56389 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CdaP56389 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CdaP56389 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CdaP56389 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CdaP56389 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CdaP56389 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CdaP56389 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CdaP56389 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CdaP56389 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CdaP56389 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CdaP56389 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CdaP56389 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CdaP56389 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CdaP56389 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CdaP56389 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CdaP56389 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CdaP56389 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CdaP56389 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CdaP56389 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CdaP56389 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CdaP56389 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CdaP56389 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CdaP56389 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CdaP56389 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CdaP56389 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CdaP56389 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CdaP56389 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CdaP56389 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CdaP56389 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CdaP56389 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CdaP56389 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CdaP56389 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CdaP56389 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CdaP56389 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CdaP56389 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CdaP56389 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CdaP56389 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CdaP56389 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CdaP56389 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CdaP56389 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CdaP56389 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CdaP56389 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CdaP56389 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CdaP56389 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CdaP56389 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CdaP56389 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CdaP56389 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CdaP56389 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CdaP56389 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CdaP56389 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CdaP56389 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CdaP56389 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CdaP56389 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CdaP56389 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CdaP56389 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CdaP56389 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CdaP56389 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CdaP56389 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CdaP56389 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CdaP56389 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CdaP56389 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CdaP56389 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CdaP56389 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CdaP56389 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CdaP56389 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CdaP56389 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CdaP56389 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CdaP56389 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CdaP56389 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CdaP56389 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CdaP56389 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CdaP56389 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CdaP56389 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CdaP56389 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CdaP56389 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CdaP56389 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CdaP56389 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CdaP56389 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CdaP56389 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CdaP56389 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CdaP56389 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CdaP56389 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CdaP56389 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CdaP56389 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CdaP56389 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CdaP56389 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CdaP56389 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CdaP56389 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CdaP56389 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CdaP56389 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms