Protein–RNA interactions for Protein: P55096

Abcd3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, mousemouse

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd3P55096 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Abcd3P55096 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Abcd3P55096 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Abcd3P55096 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Abcd3P55096 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Abcd3P55096 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Abcd3P55096 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Abcd3P55096 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Abcd3P55096 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Abcd3P55096 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Abcd3P55096 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Abcd3P55096 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Abcd3P55096 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Abcd3P55096 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Abcd3P55096 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Abcd3P55096 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Abcd3P55096 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Abcd3P55096 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Abcd3P55096 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Abcd3P55096 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Abcd3P55096 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Abcd3P55096 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Abcd3P55096 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Abcd3P55096 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Abcd3P55096 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Abcd3P55096 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Abcd3P55096 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Abcd3P55096 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Abcd3P55096 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Abcd3P55096 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Abcd3P55096 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Abcd3P55096 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Abcd3P55096 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Abcd3P55096 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Abcd3P55096 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Abcd3P55096 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Abcd3P55096 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Abcd3P55096 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Abcd3P55096 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Abcd3P55096 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Abcd3P55096 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Abcd3P55096 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Abcd3P55096 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Abcd3P55096 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Abcd3P55096 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Abcd3P55096 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Abcd3P55096 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Abcd3P55096 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Abcd3P55096 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Abcd3P55096 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Abcd3P55096 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Abcd3P55096 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Abcd3P55096 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Abcd3P55096 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Abcd3P55096 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Abcd3P55096 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Abcd3P55096 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Abcd3P55096 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Abcd3P55096 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Abcd3P55096 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Abcd3P55096 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Abcd3P55096 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Abcd3P55096 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Abcd3P55096 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Abcd3P55096 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Abcd3P55096 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Abcd3P55096 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Abcd3P55096 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Abcd3P55096 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Abcd3P55096 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Abcd3P55096 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Abcd3P55096 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Abcd3P55096 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Abcd3P55096 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Abcd3P55096 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Abcd3P55096 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Abcd3P55096 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Abcd3P55096 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Abcd3P55096 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Abcd3P55096 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Abcd3P55096 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Abcd3P55096 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Abcd3P55096 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Abcd3P55096 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Abcd3P55096 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Abcd3P55096 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Abcd3P55096 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Abcd3P55096 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Abcd3P55096 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Abcd3P55096 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Abcd3P55096 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Abcd3P55096 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Abcd3P55096 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Abcd3P55096 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Abcd3P55096 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Abcd3P55096 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Abcd3P55096 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Abcd3P55096 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Abcd3P55096 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Abcd3P55096 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms