Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rad23aP54726 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rad23aP54726 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rad23aP54726 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rad23aP54726 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rad23aP54726 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rad23aP54726 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rad23aP54726 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Rad23aP54726 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rad23aP54726 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rad23aP54726 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Rad23aP54726 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rad23aP54726 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rad23aP54726 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rad23aP54726 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rad23aP54726 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rad23aP54726 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rad23aP54726 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rad23aP54726 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rad23aP54726 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rad23aP54726 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rad23aP54726 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rad23aP54726 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rad23aP54726 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rad23aP54726 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rad23aP54726 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rad23aP54726 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rad23aP54726 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rad23aP54726 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rad23aP54726 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rad23aP54726 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Rad23aP54726 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rad23aP54726 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rad23aP54726 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rad23aP54726 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rad23aP54726 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rad23aP54726 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rad23aP54726 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rad23aP54726 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rad23aP54726 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rad23aP54726 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rad23aP54726 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Rad23aP54726 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rad23aP54726 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Rad23aP54726 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rad23aP54726 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rad23aP54726 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rad23aP54726 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rad23aP54726 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rad23aP54726 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rad23aP54726 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rad23aP54726 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rad23aP54726 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rad23aP54726 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rad23aP54726 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rad23aP54726 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rad23aP54726 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rad23aP54726 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rad23aP54726 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rad23aP54726 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rad23aP54726 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rad23aP54726 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rad23aP54726 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rad23aP54726 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rad23aP54726 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rad23aP54726 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rad23aP54726 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rad23aP54726 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rad23aP54726 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rad23aP54726 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rad23aP54726 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rad23aP54726 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Rad23aP54726 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Rad23aP54726 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Rad23aP54726 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Rad23aP54726 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rad23aP54726 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Rad23aP54726 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rad23aP54726 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rad23aP54726 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rad23aP54726 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rad23aP54726 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rad23aP54726 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rad23aP54726 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rad23aP54726 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rad23aP54726 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rad23aP54726 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rad23aP54726 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rad23aP54726 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rad23aP54726 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rad23aP54726 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rad23aP54726 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Rad23aP54726 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rad23aP54726 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rad23aP54726 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rad23aP54726 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rad23aP54726 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rad23aP54726 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rad23aP54726 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rad23aP54726 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms