Protein–RNA interactions for Protein: P53994

Rab2a, Ras-related protein Rab-2A, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab2aP53994 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab2aP53994 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab2aP53994 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab2aP53994 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab2aP53994 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab2aP53994 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab2aP53994 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab2aP53994 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab2aP53994 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab2aP53994 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab2aP53994 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab2aP53994 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab2aP53994 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab2aP53994 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab2aP53994 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab2aP53994 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab2aP53994 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab2aP53994 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab2aP53994 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab2aP53994 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab2aP53994 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab2aP53994 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab2aP53994 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab2aP53994 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab2aP53994 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab2aP53994 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab2aP53994 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab2aP53994 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab2aP53994 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab2aP53994 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab2aP53994 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab2aP53994 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab2aP53994 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab2aP53994 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab2aP53994 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab2aP53994 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab2aP53994 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab2aP53994 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab2aP53994 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab2aP53994 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab2aP53994 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab2aP53994 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab2aP53994 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab2aP53994 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rab2aP53994 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab2aP53994 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab2aP53994 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab2aP53994 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Rab2aP53994 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Rab2aP53994 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab2aP53994 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rab2aP53994 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab2aP53994 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab2aP53994 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab2aP53994 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab2aP53994 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab2aP53994 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab2aP53994 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rab2aP53994 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab2aP53994 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab2aP53994 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab2aP53994 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab2aP53994 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab2aP53994 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab2aP53994 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab2aP53994 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab2aP53994 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab2aP53994 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab2aP53994 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab2aP53994 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab2aP53994 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab2aP53994 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab2aP53994 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab2aP53994 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab2aP53994 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab2aP53994 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab2aP53994 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab2aP53994 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab2aP53994 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab2aP53994 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab2aP53994 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab2aP53994 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab2aP53994 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab2aP53994 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab2aP53994 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab2aP53994 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab2aP53994 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab2aP53994 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab2aP53994 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab2aP53994 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab2aP53994 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab2aP53994 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab2aP53994 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab2aP53994 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab2aP53994 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab2aP53994 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab2aP53994 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab2aP53994 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab2aP53994 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab2aP53994 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms