Protein–RNA interactions for Protein: P53657

Pklr, Pyruvate kinase PKLR, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PklrP53657 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PklrP53657 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PklrP53657 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PklrP53657 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PklrP53657 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PklrP53657 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PklrP53657 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PklrP53657 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PklrP53657 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PklrP53657 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PklrP53657 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PklrP53657 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PklrP53657 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PklrP53657 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PklrP53657 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
PklrP53657 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PklrP53657 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PklrP53657 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PklrP53657 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PklrP53657 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PklrP53657 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PklrP53657 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PklrP53657 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PklrP53657 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PklrP53657 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PklrP53657 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PklrP53657 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PklrP53657 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
PklrP53657 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PklrP53657 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PklrP53657 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PklrP53657 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PklrP53657 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PklrP53657 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PklrP53657 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PklrP53657 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PklrP53657 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PklrP53657 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PklrP53657 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PklrP53657 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PklrP53657 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PklrP53657 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PklrP53657 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PklrP53657 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PklrP53657 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PklrP53657 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PklrP53657 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PklrP53657 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PklrP53657 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PklrP53657 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PklrP53657 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PklrP53657 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PklrP53657 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PklrP53657 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PklrP53657 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PklrP53657 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PklrP53657 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PklrP53657 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PklrP53657 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PklrP53657 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PklrP53657 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PklrP53657 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PklrP53657 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PklrP53657 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PklrP53657 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PklrP53657 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PklrP53657 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PklrP53657 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PklrP53657 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PklrP53657 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PklrP53657 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PklrP53657 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PklrP53657 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PklrP53657 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PklrP53657 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PklrP53657 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PklrP53657 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PklrP53657 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PklrP53657 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PklrP53657 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PklrP53657 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PklrP53657 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PklrP53657 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PklrP53657 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PklrP53657 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PklrP53657 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PklrP53657 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PklrP53657 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PklrP53657 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PklrP53657 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PklrP53657 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PklrP53657 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PklrP53657 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PklrP53657 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PklrP53657 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PklrP53657 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PklrP53657 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PklrP53657 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PklrP53657 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PklrP53657 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms