Protein–RNA interactions for Protein: P51491

Opn1sw, Short-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1swP51491 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Opn1swP51491 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Opn1swP51491 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Opn1swP51491 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Opn1swP51491 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Opn1swP51491 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Opn1swP51491 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Opn1swP51491 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Opn1swP51491 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Opn1swP51491 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Opn1swP51491 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Opn1swP51491 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Opn1swP51491 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Opn1swP51491 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Opn1swP51491 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Opn1swP51491 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Opn1swP51491 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Opn1swP51491 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Opn1swP51491 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Opn1swP51491 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Opn1swP51491 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Opn1swP51491 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Opn1swP51491 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Opn1swP51491 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Opn1swP51491 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Opn1swP51491 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Opn1swP51491 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Opn1swP51491 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Opn1swP51491 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Opn1swP51491 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Opn1swP51491 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Opn1swP51491 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Opn1swP51491 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Opn1swP51491 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Opn1swP51491 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Opn1swP51491 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Opn1swP51491 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Opn1swP51491 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Opn1swP51491 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Opn1swP51491 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Opn1swP51491 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Opn1swP51491 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Opn1swP51491 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Opn1swP51491 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Opn1swP51491 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Opn1swP51491 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Opn1swP51491 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Opn1swP51491 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Opn1swP51491 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Opn1swP51491 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Opn1swP51491 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Opn1swP51491 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Opn1swP51491 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Opn1swP51491 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Opn1swP51491 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Opn1swP51491 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Opn1swP51491 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Opn1swP51491 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Opn1swP51491 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Opn1swP51491 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Opn1swP51491 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Opn1swP51491 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Opn1swP51491 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Opn1swP51491 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Opn1swP51491 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Opn1swP51491 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Opn1swP51491 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Opn1swP51491 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Opn1swP51491 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Opn1swP51491 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Opn1swP51491 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Opn1swP51491 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Opn1swP51491 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Opn1swP51491 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Opn1swP51491 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Opn1swP51491 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Opn1swP51491 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Opn1swP51491 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Opn1swP51491 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Opn1swP51491 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Opn1swP51491 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Opn1swP51491 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Opn1swP51491 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Opn1swP51491 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Opn1swP51491 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Opn1swP51491 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Opn1swP51491 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Opn1swP51491 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Opn1swP51491 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Opn1swP51491 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Opn1swP51491 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Opn1swP51491 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Opn1swP51491 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Opn1swP51491 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Opn1swP51491 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Opn1swP51491 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Opn1swP51491 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Opn1swP51491 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Opn1swP51491 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Opn1swP51491 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms