Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TspoP50637 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TspoP50637 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TspoP50637 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TspoP50637 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TspoP50637 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TspoP50637 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TspoP50637 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TspoP50637 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TspoP50637 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TspoP50637 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TspoP50637 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TspoP50637 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TspoP50637 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TspoP50637 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TspoP50637 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TspoP50637 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TspoP50637 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TspoP50637 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TspoP50637 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TspoP50637 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TspoP50637 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TspoP50637 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TspoP50637 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TspoP50637 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TspoP50637 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TspoP50637 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TspoP50637 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TspoP50637 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TspoP50637 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TspoP50637 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TspoP50637 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TspoP50637 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TspoP50637 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TspoP50637 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TspoP50637 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TspoP50637 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TspoP50637 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TspoP50637 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TspoP50637 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TspoP50637 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TspoP50637 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TspoP50637 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TspoP50637 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TspoP50637 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TspoP50637 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TspoP50637 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TspoP50637 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TspoP50637 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TspoP50637 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TspoP50637 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TspoP50637 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TspoP50637 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TspoP50637 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TspoP50637 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TspoP50637 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TspoP50637 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TspoP50637 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TspoP50637 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TspoP50637 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TspoP50637 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TspoP50637 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TspoP50637 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TspoP50637 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TspoP50637 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TspoP50637 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TspoP50637 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TspoP50637 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TspoP50637 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TspoP50637 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TspoP50637 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TspoP50637 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TspoP50637 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TspoP50637 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TspoP50637 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TspoP50637 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TspoP50637 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TspoP50637 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TspoP50637 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TspoP50637 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TspoP50637 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TspoP50637 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TspoP50637 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TspoP50637 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TspoP50637 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TspoP50637 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TspoP50637 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TspoP50637 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TspoP50637 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TspoP50637 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TspoP50637 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TspoP50637 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TspoP50637 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TspoP50637 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TspoP50637 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TspoP50637 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TspoP50637 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TspoP50637 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TspoP50637 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TspoP50637 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms