Protein–RNA interactions for Protein: P50283

Cd7, T-cell antigen CD7, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd7P50283 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd7P50283 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd7P50283 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd7P50283 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd7P50283 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd7P50283 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd7P50283 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd7P50283 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd7P50283 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd7P50283 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd7P50283 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd7P50283 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd7P50283 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd7P50283 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd7P50283 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd7P50283 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd7P50283 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd7P50283 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd7P50283 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd7P50283 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd7P50283 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd7P50283 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd7P50283 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd7P50283 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd7P50283 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd7P50283 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd7P50283 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd7P50283 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd7P50283 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd7P50283 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd7P50283 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd7P50283 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd7P50283 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd7P50283 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd7P50283 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd7P50283 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd7P50283 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd7P50283 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd7P50283 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd7P50283 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd7P50283 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd7P50283 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd7P50283 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd7P50283 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd7P50283 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd7P50283 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd7P50283 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd7P50283 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd7P50283 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd7P50283 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd7P50283 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd7P50283 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd7P50283 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd7P50283 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd7P50283 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd7P50283 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd7P50283 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd7P50283 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd7P50283 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd7P50283 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd7P50283 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd7P50283 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd7P50283 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd7P50283 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd7P50283 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd7P50283 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd7P50283 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd7P50283 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd7P50283 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd7P50283 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd7P50283 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd7P50283 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd7P50283 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd7P50283 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd7P50283 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd7P50283 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd7P50283 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd7P50283 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd7P50283 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd7P50283 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd7P50283 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd7P50283 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd7P50283 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd7P50283 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd7P50283 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd7P50283 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd7P50283 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd7P50283 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd7P50283 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd7P50283 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd7P50283 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd7P50283 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd7P50283 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd7P50283 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd7P50283 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd7P50283 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd7P50283 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd7P50283 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd7P50283 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd7P50283 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.3 ms