Protein–RNA interactions for Protein: P50228

Cxcl5, C-X-C motif chemokine 5, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl5P50228 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cxcl5P50228 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cxcl5P50228 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cxcl5P50228 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cxcl5P50228 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cxcl5P50228 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cxcl5P50228 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cxcl5P50228 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cxcl5P50228 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cxcl5P50228 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cxcl5P50228 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cxcl5P50228 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cxcl5P50228 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cxcl5P50228 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cxcl5P50228 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cxcl5P50228 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cxcl5P50228 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cxcl5P50228 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cxcl5P50228 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cxcl5P50228 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cxcl5P50228 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cxcl5P50228 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cxcl5P50228 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cxcl5P50228 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cxcl5P50228 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cxcl5P50228 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cxcl5P50228 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cxcl5P50228 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cxcl5P50228 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cxcl5P50228 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cxcl5P50228 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cxcl5P50228 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cxcl5P50228 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cxcl5P50228 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cxcl5P50228 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cxcl5P50228 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cxcl5P50228 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cxcl5P50228 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cxcl5P50228 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cxcl5P50228 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cxcl5P50228 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cxcl5P50228 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cxcl5P50228 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cxcl5P50228 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cxcl5P50228 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cxcl5P50228 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cxcl5P50228 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cxcl5P50228 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cxcl5P50228 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cxcl5P50228 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cxcl5P50228 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cxcl5P50228 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cxcl5P50228 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cxcl5P50228 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cxcl5P50228 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cxcl5P50228 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cxcl5P50228 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cxcl5P50228 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cxcl5P50228 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cxcl5P50228 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cxcl5P50228 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cxcl5P50228 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cxcl5P50228 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cxcl5P50228 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cxcl5P50228 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cxcl5P50228 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cxcl5P50228 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cxcl5P50228 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cxcl5P50228 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cxcl5P50228 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cxcl5P50228 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cxcl5P50228 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cxcl5P50228 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cxcl5P50228 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cxcl5P50228 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cxcl5P50228 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cxcl5P50228 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cxcl5P50228 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cxcl5P50228 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cxcl5P50228 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cxcl5P50228 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cxcl5P50228 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cxcl5P50228 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cxcl5P50228 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cxcl5P50228 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cxcl5P50228 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cxcl5P50228 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cxcl5P50228 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cxcl5P50228 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cxcl5P50228 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cxcl5P50228 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cxcl5P50228 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cxcl5P50228 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cxcl5P50228 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cxcl5P50228 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cxcl5P50228 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cxcl5P50228 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cxcl5P50228 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cxcl5P50228 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cxcl5P50228 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms