Protein–RNA interactions for Protein: P49766

Vegfb, Vascular endothelial growth factor B, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfbP49766 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VegfbP49766 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VegfbP49766 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VegfbP49766 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VegfbP49766 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VegfbP49766 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VegfbP49766 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VegfbP49766 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VegfbP49766 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VegfbP49766 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VegfbP49766 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VegfbP49766 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VegfbP49766 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VegfbP49766 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VegfbP49766 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VegfbP49766 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VegfbP49766 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VegfbP49766 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VegfbP49766 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VegfbP49766 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VegfbP49766 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VegfbP49766 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VegfbP49766 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VegfbP49766 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VegfbP49766 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VegfbP49766 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VegfbP49766 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VegfbP49766 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VegfbP49766 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VegfbP49766 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VegfbP49766 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
VegfbP49766 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VegfbP49766 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VegfbP49766 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VegfbP49766 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VegfbP49766 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VegfbP49766 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VegfbP49766 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VegfbP49766 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VegfbP49766 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VegfbP49766 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VegfbP49766 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VegfbP49766 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VegfbP49766 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VegfbP49766 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VegfbP49766 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VegfbP49766 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VegfbP49766 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VegfbP49766 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VegfbP49766 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VegfbP49766 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VegfbP49766 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VegfbP49766 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
VegfbP49766 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VegfbP49766 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VegfbP49766 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VegfbP49766 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VegfbP49766 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VegfbP49766 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VegfbP49766 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VegfbP49766 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VegfbP49766 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VegfbP49766 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VegfbP49766 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VegfbP49766 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VegfbP49766 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
VegfbP49766 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VegfbP49766 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VegfbP49766 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VegfbP49766 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VegfbP49766 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VegfbP49766 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VegfbP49766 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VegfbP49766 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VegfbP49766 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VegfbP49766 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VegfbP49766 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VegfbP49766 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
VegfbP49766 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VegfbP49766 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VegfbP49766 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VegfbP49766 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
VegfbP49766 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VegfbP49766 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VegfbP49766 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VegfbP49766 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VegfbP49766 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VegfbP49766 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VegfbP49766 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VegfbP49766 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VegfbP49766 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VegfbP49766 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VegfbP49766 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VegfbP49766 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VegfbP49766 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VegfbP49766 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VegfbP49766 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VegfbP49766 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
VegfbP49766 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VegfbP49766 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms