Protein–RNA interactions for Protein: P49764

Pgf, Placenta growth factor, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PgfP49764 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PgfP49764 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PgfP49764 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PgfP49764 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PgfP49764 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PgfP49764 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PgfP49764 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PgfP49764 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PgfP49764 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PgfP49764 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PgfP49764 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PgfP49764 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PgfP49764 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PgfP49764 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PgfP49764 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PgfP49764 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PgfP49764 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PgfP49764 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PgfP49764 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PgfP49764 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PgfP49764 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PgfP49764 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PgfP49764 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PgfP49764 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PgfP49764 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PgfP49764 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PgfP49764 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PgfP49764 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PgfP49764 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PgfP49764 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PgfP49764 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PgfP49764 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PgfP49764 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PgfP49764 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PgfP49764 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PgfP49764 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PgfP49764 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PgfP49764 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PgfP49764 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PgfP49764 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PgfP49764 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PgfP49764 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PgfP49764 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PgfP49764 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PgfP49764 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PgfP49764 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PgfP49764 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PgfP49764 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PgfP49764 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PgfP49764 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PgfP49764 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PgfP49764 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PgfP49764 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PgfP49764 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PgfP49764 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PgfP49764 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PgfP49764 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PgfP49764 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PgfP49764 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PgfP49764 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PgfP49764 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PgfP49764 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PgfP49764 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PgfP49764 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PgfP49764 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PgfP49764 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PgfP49764 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PgfP49764 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PgfP49764 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PgfP49764 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PgfP49764 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PgfP49764 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PgfP49764 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PgfP49764 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PgfP49764 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PgfP49764 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PgfP49764 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PgfP49764 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PgfP49764 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PgfP49764 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PgfP49764 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PgfP49764 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PgfP49764 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PgfP49764 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PgfP49764 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PgfP49764 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PgfP49764 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PgfP49764 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PgfP49764 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PgfP49764 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PgfP49764 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PgfP49764 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PgfP49764 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PgfP49764 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PgfP49764 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PgfP49764 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PgfP49764 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PgfP49764 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PgfP49764 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PgfP49764 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms