Protein–RNA interactions for Protein: P49222

Epb42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, mousemouse

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb42P49222 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Epb42P49222 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Epb42P49222 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Epb42P49222 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Epb42P49222 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Epb42P49222 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Epb42P49222 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Epb42P49222 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Epb42P49222 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Epb42P49222 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Epb42P49222 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Epb42P49222 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Epb42P49222 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Epb42P49222 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Epb42P49222 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Epb42P49222 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Epb42P49222 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Epb42P49222 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Epb42P49222 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Epb42P49222 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Epb42P49222 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Epb42P49222 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Epb42P49222 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Epb42P49222 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Epb42P49222 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Epb42P49222 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Epb42P49222 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Epb42P49222 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Epb42P49222 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Epb42P49222 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Epb42P49222 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Epb42P49222 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Epb42P49222 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Epb42P49222 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Epb42P49222 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Epb42P49222 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Epb42P49222 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Epb42P49222 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Epb42P49222 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Epb42P49222 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Epb42P49222 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Epb42P49222 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Epb42P49222 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Epb42P49222 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Epb42P49222 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Epb42P49222 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Epb42P49222 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Epb42P49222 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Epb42P49222 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Epb42P49222 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Epb42P49222 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Epb42P49222 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Epb42P49222 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Epb42P49222 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Epb42P49222 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Epb42P49222 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Epb42P49222 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Epb42P49222 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Epb42P49222 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Epb42P49222 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Epb42P49222 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Epb42P49222 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Epb42P49222 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Epb42P49222 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Epb42P49222 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Epb42P49222 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Epb42P49222 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Epb42P49222 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Epb42P49222 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Epb42P49222 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Epb42P49222 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Epb42P49222 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Epb42P49222 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Epb42P49222 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Epb42P49222 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Epb42P49222 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Epb42P49222 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Epb42P49222 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Epb42P49222 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Epb42P49222 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Epb42P49222 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Epb42P49222 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Epb42P49222 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Epb42P49222 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Epb42P49222 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Epb42P49222 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Epb42P49222 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Epb42P49222 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Epb42P49222 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Epb42P49222 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Epb42P49222 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Epb42P49222 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Epb42P49222 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Epb42P49222 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Epb42P49222 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Epb42P49222 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Epb42P49222 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Epb42P49222 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Epb42P49222 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Epb42P49222 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms