Protein–RNA interactions for Protein: P48437

Prox1, Prospero homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prox1P48437 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prox1P48437 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prox1P48437 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prox1P48437 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prox1P48437 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prox1P48437 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prox1P48437 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prox1P48437 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prox1P48437 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prox1P48437 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Prox1P48437 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prox1P48437 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prox1P48437 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prox1P48437 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prox1P48437 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prox1P48437 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prox1P48437 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prox1P48437 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prox1P48437 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prox1P48437 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prox1P48437 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prox1P48437 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prox1P48437 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prox1P48437 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Prox1P48437 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prox1P48437 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prox1P48437 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prox1P48437 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prox1P48437 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prox1P48437 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prox1P48437 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prox1P48437 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prox1P48437 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prox1P48437 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Prox1P48437 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prox1P48437 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prox1P48437 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prox1P48437 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Prox1P48437 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Prox1P48437 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prox1P48437 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prox1P48437 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prox1P48437 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prox1P48437 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prox1P48437 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prox1P48437 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prox1P48437 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prox1P48437 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prox1P48437 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prox1P48437 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prox1P48437 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prox1P48437 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prox1P48437 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prox1P48437 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prox1P48437 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prox1P48437 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Prox1P48437 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prox1P48437 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prox1P48437 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prox1P48437 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prox1P48437 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prox1P48437 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prox1P48437 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prox1P48437 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Prox1P48437 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prox1P48437 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prox1P48437 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prox1P48437 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prox1P48437 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prox1P48437 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prox1P48437 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prox1P48437 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prox1P48437 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prox1P48437 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Prox1P48437 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prox1P48437 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prox1P48437 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prox1P48437 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prox1P48437 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prox1P48437 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prox1P48437 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Prox1P48437 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prox1P48437 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prox1P48437 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prox1P48437 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prox1P48437 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prox1P48437 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prox1P48437 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prox1P48437 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prox1P48437 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prox1P48437 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prox1P48437 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Prox1P48437 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prox1P48437 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prox1P48437 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prox1P48437 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prox1P48437 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Prox1P48437 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prox1P48437 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prox1P48437 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms