Protein–RNA interactions for Protein: P48377

Rfx1, MHC class II regulatory factor RFX1, mousemouse

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx1P48377 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rfx1P48377 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rfx1P48377 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Rfx1P48377 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rfx1P48377 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rfx1P48377 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rfx1P48377 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rfx1P48377 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rfx1P48377 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rfx1P48377 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rfx1P48377 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rfx1P48377 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rfx1P48377 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rfx1P48377 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rfx1P48377 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rfx1P48377 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rfx1P48377 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rfx1P48377 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rfx1P48377 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rfx1P48377 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rfx1P48377 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rfx1P48377 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rfx1P48377 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rfx1P48377 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rfx1P48377 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rfx1P48377 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rfx1P48377 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rfx1P48377 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rfx1P48377 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rfx1P48377 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rfx1P48377 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rfx1P48377 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rfx1P48377 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rfx1P48377 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rfx1P48377 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rfx1P48377 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rfx1P48377 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rfx1P48377 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rfx1P48377 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rfx1P48377 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rfx1P48377 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rfx1P48377 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rfx1P48377 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rfx1P48377 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rfx1P48377 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rfx1P48377 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rfx1P48377 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rfx1P48377 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rfx1P48377 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rfx1P48377 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rfx1P48377 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rfx1P48377 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rfx1P48377 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rfx1P48377 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rfx1P48377 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rfx1P48377 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rfx1P48377 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rfx1P48377 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rfx1P48377 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rfx1P48377 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rfx1P48377 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rfx1P48377 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rfx1P48377 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Rfx1P48377 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rfx1P48377 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Rfx1P48377 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rfx1P48377 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rfx1P48377 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rfx1P48377 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rfx1P48377 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Rfx1P48377 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rfx1P48377 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Rfx1P48377 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rfx1P48377 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rfx1P48377 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rfx1P48377 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Rfx1P48377 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rfx1P48377 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Rfx1P48377 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rfx1P48377 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rfx1P48377 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rfx1P48377 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rfx1P48377 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rfx1P48377 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rfx1P48377 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rfx1P48377 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rfx1P48377 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rfx1P48377 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rfx1P48377 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rfx1P48377 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Rfx1P48377 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rfx1P48377 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rfx1P48377 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rfx1P48377 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rfx1P48377 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rfx1P48377 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rfx1P48377 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Rfx1P48377 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Rfx1P48377 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rfx1P48377 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms