Protein–RNA interactions for Protein: P48031

Gbx2, Homeobox protein GBX-2, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx2P48031 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gbx2P48031 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gbx2P48031 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gbx2P48031 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gbx2P48031 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gbx2P48031 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gbx2P48031 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gbx2P48031 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gbx2P48031 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gbx2P48031 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gbx2P48031 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gbx2P48031 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gbx2P48031 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gbx2P48031 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gbx2P48031 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gbx2P48031 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gbx2P48031 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gbx2P48031 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gbx2P48031 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gbx2P48031 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gbx2P48031 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gbx2P48031 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gbx2P48031 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gbx2P48031 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gbx2P48031 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gbx2P48031 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gbx2P48031 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gbx2P48031 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gbx2P48031 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gbx2P48031 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gbx2P48031 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gbx2P48031 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gbx2P48031 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gbx2P48031 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gbx2P48031 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gbx2P48031 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gbx2P48031 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gbx2P48031 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gbx2P48031 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gbx2P48031 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gbx2P48031 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gbx2P48031 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gbx2P48031 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gbx2P48031 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gbx2P48031 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gbx2P48031 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gbx2P48031 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gbx2P48031 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gbx2P48031 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gbx2P48031 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gbx2P48031 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gbx2P48031 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gbx2P48031 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gbx2P48031 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gbx2P48031 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gbx2P48031 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gbx2P48031 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gbx2P48031 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gbx2P48031 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gbx2P48031 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gbx2P48031 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gbx2P48031 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gbx2P48031 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gbx2P48031 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gbx2P48031 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gbx2P48031 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gbx2P48031 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gbx2P48031 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gbx2P48031 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gbx2P48031 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gbx2P48031 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gbx2P48031 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gbx2P48031 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gbx2P48031 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gbx2P48031 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gbx2P48031 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gbx2P48031 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gbx2P48031 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gbx2P48031 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gbx2P48031 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gbx2P48031 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gbx2P48031 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gbx2P48031 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gbx2P48031 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gbx2P48031 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gbx2P48031 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gbx2P48031 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gbx2P48031 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Gbx2P48031 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gbx2P48031 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gbx2P48031 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gbx2P48031 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gbx2P48031 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gbx2P48031 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gbx2P48031 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gbx2P48031 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gbx2P48031 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gbx2P48031 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gbx2P48031 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gbx2P48031 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms