Protein–RNA interactions for Protein: P47242

Pax9, Paired box protein Pax-9, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax9P47242 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pax9P47242 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pax9P47242 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pax9P47242 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pax9P47242 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pax9P47242 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pax9P47242 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pax9P47242 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pax9P47242 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pax9P47242 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pax9P47242 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pax9P47242 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pax9P47242 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pax9P47242 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pax9P47242 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pax9P47242 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pax9P47242 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pax9P47242 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pax9P47242 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pax9P47242 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pax9P47242 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pax9P47242 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pax9P47242 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pax9P47242 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pax9P47242 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pax9P47242 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pax9P47242 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pax9P47242 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pax9P47242 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pax9P47242 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pax9P47242 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pax9P47242 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pax9P47242 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pax9P47242 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pax9P47242 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pax9P47242 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pax9P47242 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pax9P47242 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pax9P47242 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pax9P47242 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pax9P47242 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pax9P47242 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pax9P47242 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pax9P47242 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pax9P47242 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pax9P47242 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pax9P47242 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pax9P47242 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pax9P47242 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pax9P47242 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pax9P47242 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pax9P47242 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pax9P47242 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pax9P47242 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pax9P47242 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pax9P47242 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pax9P47242 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pax9P47242 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pax9P47242 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pax9P47242 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pax9P47242 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pax9P47242 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pax9P47242 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pax9P47242 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pax9P47242 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pax9P47242 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pax9P47242 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pax9P47242 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pax9P47242 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Pax9P47242 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pax9P47242 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pax9P47242 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pax9P47242 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pax9P47242 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pax9P47242 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pax9P47242 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pax9P47242 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pax9P47242 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pax9P47242 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pax9P47242 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pax9P47242 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pax9P47242 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pax9P47242 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pax9P47242 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pax9P47242 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Pax9P47242 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pax9P47242 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pax9P47242 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Pax9P47242 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pax9P47242 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pax9P47242 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pax9P47242 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pax9P47242 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pax9P47242 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Pax9P47242 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pax9P47242 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pax9P47242 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pax9P47242 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pax9P47242 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pax9P47242 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms