Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PtgfrP43117 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PtgfrP43117 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PtgfrP43117 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PtgfrP43117 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PtgfrP43117 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PtgfrP43117 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtgfrP43117 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtgfrP43117 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtgfrP43117 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtgfrP43117 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtgfrP43117 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtgfrP43117 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtgfrP43117 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtgfrP43117 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtgfrP43117 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtgfrP43117 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtgfrP43117 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtgfrP43117 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtgfrP43117 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtgfrP43117 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtgfrP43117 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtgfrP43117 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtgfrP43117 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtgfrP43117 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtgfrP43117 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtgfrP43117 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtgfrP43117 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtgfrP43117 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtgfrP43117 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtgfrP43117 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtgfrP43117 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtgfrP43117 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtgfrP43117 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtgfrP43117 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PtgfrP43117 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtgfrP43117 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtgfrP43117 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtgfrP43117 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtgfrP43117 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtgfrP43117 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtgfrP43117 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtgfrP43117 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtgfrP43117 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtgfrP43117 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtgfrP43117 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtgfrP43117 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtgfrP43117 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtgfrP43117 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtgfrP43117 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtgfrP43117 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtgfrP43117 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PtgfrP43117 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PtgfrP43117 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtgfrP43117 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtgfrP43117 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtgfrP43117 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtgfrP43117 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtgfrP43117 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtgfrP43117 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtgfrP43117 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtgfrP43117 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtgfrP43117 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtgfrP43117 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtgfrP43117 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtgfrP43117 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtgfrP43117 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtgfrP43117 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtgfrP43117 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtgfrP43117 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtgfrP43117 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtgfrP43117 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtgfrP43117 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtgfrP43117 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtgfrP43117 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtgfrP43117 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PtgfrP43117 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PtgfrP43117 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PtgfrP43117 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PtgfrP43117 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PtgfrP43117 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PtgfrP43117 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PtgfrP43117 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PtgfrP43117 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PtgfrP43117 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PtgfrP43117 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PtgfrP43117 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PtgfrP43117 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PtgfrP43117 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PtgfrP43117 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PtgfrP43117 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtgfrP43117 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtgfrP43117 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtgfrP43117 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtgfrP43117 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtgfrP43117 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtgfrP43117 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtgfrP43117 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtgfrP43117 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtgfrP43117 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms