Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
Chd1P40201 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Chd1P40201 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Chd1P40201 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Chd1P40201 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Chd1P40201 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Chd1P40201 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Chd1P40201 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Chd1P40201 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Chd1P40201 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Chd1P40201 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Chd1P40201 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Chd1P40201 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Chd1P40201 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Chd1P40201 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Chd1P40201 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Chd1P40201 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Chd1P40201 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Chd1P40201 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Chd1P40201 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Chd1P40201 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Chd1P40201 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Chd1P40201 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Chd1P40201 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Chd1P40201 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Chd1P40201 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Chd1P40201 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Chd1P40201 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Chd1P40201 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Chd1P40201 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Chd1P40201 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Chd1P40201 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Chd1P40201 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Chd1P40201 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Chd1P40201 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Chd1P40201 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
Chd1P40201 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Chd1P40201 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Chd1P40201 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Chd1P40201 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Chd1P40201 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Chd1P40201 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Chd1P40201 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Chd1P40201 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
Chd1P40201 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Chd1P40201 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Chd1P40201 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
Chd1P40201 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Chd1P40201 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Chd1P40201 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Chd1P40201 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Chd1P40201 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Chd1P40201 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
Chd1P40201 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
Chd1P40201 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Chd1P40201 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Chd1P40201 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Chd1P40201 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Chd1P40201 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Chd1P40201 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Chd1P40201 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Chd1P40201 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
Chd1P40201 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Chd1P40201 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Chd1P40201 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Chd1P40201 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Chd1P40201 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Chd1P40201 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Chd1P40201 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Chd1P40201 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Chd1P40201 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Chd1P40201 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
Chd1P40201 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC30■■■□□ 2.39
Chd1P40201 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Chd1P40201 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Chd1P40201 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Chd1P40201 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Chd1P40201 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
Chd1P40201 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Chd1P40201 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Chd1P40201 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Chd1P40201 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
Chd1P40201 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Chd1P40201 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Chd1P40201 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Chd1P40201 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Chd1P40201 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Chd1P40201 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Chd1P40201 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Chd1P40201 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Chd1P40201 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Chd1P40201 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Chd1P40201 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Chd1P40201 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Chd1P40201 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Chd1P40201 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Chd1P40201 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Chd1P40201 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Chd1P40201 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Chd1P40201 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms