Protein–RNA interactions for Protein: P39039

Mbl1, Mannose-binding protein A, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbl1P39039 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mbl1P39039 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mbl1P39039 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mbl1P39039 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mbl1P39039 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mbl1P39039 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mbl1P39039 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mbl1P39039 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mbl1P39039 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Mbl1P39039 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mbl1P39039 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mbl1P39039 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mbl1P39039 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mbl1P39039 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mbl1P39039 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mbl1P39039 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mbl1P39039 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mbl1P39039 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mbl1P39039 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mbl1P39039 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mbl1P39039 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mbl1P39039 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mbl1P39039 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mbl1P39039 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mbl1P39039 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mbl1P39039 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mbl1P39039 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mbl1P39039 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mbl1P39039 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mbl1P39039 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mbl1P39039 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mbl1P39039 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mbl1P39039 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mbl1P39039 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mbl1P39039 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mbl1P39039 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mbl1P39039 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mbl1P39039 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mbl1P39039 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mbl1P39039 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mbl1P39039 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Mbl1P39039 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Mbl1P39039 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mbl1P39039 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mbl1P39039 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mbl1P39039 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mbl1P39039 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mbl1P39039 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mbl1P39039 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mbl1P39039 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mbl1P39039 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mbl1P39039 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mbl1P39039 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Mbl1P39039 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mbl1P39039 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mbl1P39039 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mbl1P39039 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mbl1P39039 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mbl1P39039 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mbl1P39039 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mbl1P39039 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Mbl1P39039 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mbl1P39039 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mbl1P39039 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mbl1P39039 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mbl1P39039 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mbl1P39039 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mbl1P39039 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mbl1P39039 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mbl1P39039 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mbl1P39039 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mbl1P39039 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mbl1P39039 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mbl1P39039 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mbl1P39039 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mbl1P39039 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mbl1P39039 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mbl1P39039 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mbl1P39039 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mbl1P39039 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mbl1P39039 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mbl1P39039 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mbl1P39039 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mbl1P39039 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mbl1P39039 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mbl1P39039 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Mbl1P39039 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mbl1P39039 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mbl1P39039 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mbl1P39039 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mbl1P39039 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mbl1P39039 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mbl1P39039 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mbl1P39039 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mbl1P39039 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mbl1P39039 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mbl1P39039 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mbl1P39039 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mbl1P39039 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mbl1P39039 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms