Protein–RNA interactions for Protein: P35459

Ly6d, Lymphocyte antigen 6D, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6dP35459 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ly6dP35459 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ly6dP35459 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ly6dP35459 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ly6dP35459 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ly6dP35459 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ly6dP35459 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ly6dP35459 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ly6dP35459 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ly6dP35459 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ly6dP35459 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ly6dP35459 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ly6dP35459 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ly6dP35459 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ly6dP35459 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ly6dP35459 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ly6dP35459 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ly6dP35459 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ly6dP35459 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Ly6dP35459 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ly6dP35459 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ly6dP35459 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ly6dP35459 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ly6dP35459 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ly6dP35459 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ly6dP35459 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ly6dP35459 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ly6dP35459 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ly6dP35459 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ly6dP35459 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ly6dP35459 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ly6dP35459 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ly6dP35459 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ly6dP35459 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ly6dP35459 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ly6dP35459 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ly6dP35459 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Ly6dP35459 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ly6dP35459 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ly6dP35459 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ly6dP35459 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ly6dP35459 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Ly6dP35459 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ly6dP35459 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ly6dP35459 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ly6dP35459 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ly6dP35459 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ly6dP35459 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ly6dP35459 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ly6dP35459 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ly6dP35459 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ly6dP35459 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ly6dP35459 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ly6dP35459 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ly6dP35459 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Ly6dP35459 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ly6dP35459 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ly6dP35459 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ly6dP35459 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Ly6dP35459 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ly6dP35459 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ly6dP35459 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ly6dP35459 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Ly6dP35459 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ly6dP35459 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ly6dP35459 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ly6dP35459 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ly6dP35459 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ly6dP35459 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ly6dP35459 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ly6dP35459 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ly6dP35459 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ly6dP35459 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ly6dP35459 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ly6dP35459 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ly6dP35459 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ly6dP35459 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ly6dP35459 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ly6dP35459 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ly6dP35459 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ly6dP35459 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ly6dP35459 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ly6dP35459 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ly6dP35459 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ly6dP35459 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ly6dP35459 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ly6dP35459 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ly6dP35459 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ly6dP35459 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ly6dP35459 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ly6dP35459 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ly6dP35459 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ly6dP35459 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ly6dP35459 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ly6dP35459 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ly6dP35459 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ly6dP35459 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ly6dP35459 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ly6dP35459 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ly6dP35459 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms