Protein–RNA interactions for Protein: P35438

Grin1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin1P35438 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Grin1P35438 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Grin1P35438 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Grin1P35438 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Grin1P35438 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Grin1P35438 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Grin1P35438 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Grin1P35438 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Grin1P35438 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Grin1P35438 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Grin1P35438 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Grin1P35438 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Grin1P35438 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Grin1P35438 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Grin1P35438 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Grin1P35438 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Grin1P35438 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Grin1P35438 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Grin1P35438 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Grin1P35438 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Grin1P35438 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Grin1P35438 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Grin1P35438 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Grin1P35438 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Grin1P35438 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Grin1P35438 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Grin1P35438 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Grin1P35438 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Grin1P35438 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Grin1P35438 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Grin1P35438 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Grin1P35438 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Grin1P35438 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Grin1P35438 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Grin1P35438 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Grin1P35438 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Grin1P35438 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Grin1P35438 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Grin1P35438 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Grin1P35438 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Grin1P35438 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Grin1P35438 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Grin1P35438 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Grin1P35438 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Grin1P35438 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Grin1P35438 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Grin1P35438 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Grin1P35438 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Grin1P35438 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Grin1P35438 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Grin1P35438 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Grin1P35438 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Grin1P35438 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Grin1P35438 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Grin1P35438 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Grin1P35438 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Grin1P35438 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Grin1P35438 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Grin1P35438 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Grin1P35438 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Grin1P35438 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Grin1P35438 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Grin1P35438 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Grin1P35438 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Grin1P35438 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Grin1P35438 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Grin1P35438 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Grin1P35438 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Grin1P35438 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Grin1P35438 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Grin1P35438 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Grin1P35438 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Grin1P35438 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Grin1P35438 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Grin1P35438 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Grin1P35438 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Grin1P35438 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Grin1P35438 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Grin1P35438 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Grin1P35438 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Grin1P35438 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Grin1P35438 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Grin1P35438 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Grin1P35438 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Grin1P35438 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Grin1P35438 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Grin1P35438 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Grin1P35438 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Grin1P35438 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Grin1P35438 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Grin1P35438 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Grin1P35438 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Grin1P35438 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Grin1P35438 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Grin1P35438 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Grin1P35438 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Grin1P35438 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Grin1P35438 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Grin1P35438 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Grin1P35438 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms