Protein–RNA interactions for Protein: P33622

Apoc3, Apolipoprotein C-III, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc3P33622 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apoc3P33622 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apoc3P33622 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apoc3P33622 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Apoc3P33622 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apoc3P33622 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Apoc3P33622 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apoc3P33622 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Apoc3P33622 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apoc3P33622 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apoc3P33622 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apoc3P33622 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apoc3P33622 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apoc3P33622 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apoc3P33622 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apoc3P33622 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apoc3P33622 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apoc3P33622 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apoc3P33622 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apoc3P33622 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apoc3P33622 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apoc3P33622 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apoc3P33622 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apoc3P33622 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apoc3P33622 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apoc3P33622 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apoc3P33622 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apoc3P33622 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apoc3P33622 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apoc3P33622 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apoc3P33622 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apoc3P33622 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apoc3P33622 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apoc3P33622 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apoc3P33622 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apoc3P33622 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apoc3P33622 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apoc3P33622 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apoc3P33622 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apoc3P33622 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apoc3P33622 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apoc3P33622 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apoc3P33622 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apoc3P33622 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apoc3P33622 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apoc3P33622 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apoc3P33622 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apoc3P33622 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apoc3P33622 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apoc3P33622 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apoc3P33622 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apoc3P33622 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apoc3P33622 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Apoc3P33622 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Apoc3P33622 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Apoc3P33622 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Apoc3P33622 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Apoc3P33622 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apoc3P33622 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apoc3P33622 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apoc3P33622 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apoc3P33622 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apoc3P33622 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apoc3P33622 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apoc3P33622 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apoc3P33622 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apoc3P33622 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apoc3P33622 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Apoc3P33622 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apoc3P33622 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Apoc3P33622 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apoc3P33622 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apoc3P33622 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apoc3P33622 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apoc3P33622 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apoc3P33622 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apoc3P33622 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apoc3P33622 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apoc3P33622 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apoc3P33622 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apoc3P33622 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apoc3P33622 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apoc3P33622 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Apoc3P33622 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apoc3P33622 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apoc3P33622 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apoc3P33622 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apoc3P33622 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apoc3P33622 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apoc3P33622 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apoc3P33622 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apoc3P33622 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apoc3P33622 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apoc3P33622 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apoc3P33622 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apoc3P33622 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apoc3P33622 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apoc3P33622 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apoc3P33622 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apoc3P33622 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms