Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nedd1P33215 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nedd1P33215 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Nedd1P33215 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nedd1P33215 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Nedd1P33215 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nedd1P33215 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nedd1P33215 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nedd1P33215 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nedd1P33215 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Nedd1P33215 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nedd1P33215 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nedd1P33215 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nedd1P33215 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nedd1P33215 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nedd1P33215 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nedd1P33215 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nedd1P33215 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nedd1P33215 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nedd1P33215 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nedd1P33215 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nedd1P33215 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nedd1P33215 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nedd1P33215 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nedd1P33215 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Nedd1P33215 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Nedd1P33215 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nedd1P33215 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nedd1P33215 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nedd1P33215 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nedd1P33215 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nedd1P33215 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Nedd1P33215 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nedd1P33215 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nedd1P33215 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nedd1P33215 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nedd1P33215 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nedd1P33215 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nedd1P33215 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nedd1P33215 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nedd1P33215 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nedd1P33215 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nedd1P33215 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nedd1P33215 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nedd1P33215 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Nedd1P33215 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nedd1P33215 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nedd1P33215 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nedd1P33215 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nedd1P33215 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nedd1P33215 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nedd1P33215 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nedd1P33215 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nedd1P33215 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nedd1P33215 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nedd1P33215 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Nedd1P33215 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nedd1P33215 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nedd1P33215 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nedd1P33215 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nedd1P33215 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Nedd1P33215 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nedd1P33215 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nedd1P33215 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nedd1P33215 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nedd1P33215 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nedd1P33215 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nedd1P33215 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nedd1P33215 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nedd1P33215 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nedd1P33215 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nedd1P33215 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nedd1P33215 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nedd1P33215 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Nedd1P33215 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nedd1P33215 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nedd1P33215 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nedd1P33215 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nedd1P33215 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nedd1P33215 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nedd1P33215 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nedd1P33215 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nedd1P33215 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Nedd1P33215 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nedd1P33215 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nedd1P33215 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nedd1P33215 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Nedd1P33215 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nedd1P33215 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nedd1P33215 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nedd1P33215 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nedd1P33215 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nedd1P33215 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Nedd1P33215 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nedd1P33215 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nedd1P33215 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nedd1P33215 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nedd1P33215 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nedd1P33215 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nedd1P33215 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms