Protein–RNA interactions for Protein: P32067

Ssb, Lupus La protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SsbP32067 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SsbP32067 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SsbP32067 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SsbP32067 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SsbP32067 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SsbP32067 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SsbP32067 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SsbP32067 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SsbP32067 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SsbP32067 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SsbP32067 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SsbP32067 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SsbP32067 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SsbP32067 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SsbP32067 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SsbP32067 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SsbP32067 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SsbP32067 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SsbP32067 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SsbP32067 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SsbP32067 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SsbP32067 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SsbP32067 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SsbP32067 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SsbP32067 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SsbP32067 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SsbP32067 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SsbP32067 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SsbP32067 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SsbP32067 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SsbP32067 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SsbP32067 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SsbP32067 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SsbP32067 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SsbP32067 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SsbP32067 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SsbP32067 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SsbP32067 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SsbP32067 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SsbP32067 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SsbP32067 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SsbP32067 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SsbP32067 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SsbP32067 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SsbP32067 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SsbP32067 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SsbP32067 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SsbP32067 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SsbP32067 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SsbP32067 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SsbP32067 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SsbP32067 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SsbP32067 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SsbP32067 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SsbP32067 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SsbP32067 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SsbP32067 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SsbP32067 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SsbP32067 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SsbP32067 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SsbP32067 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SsbP32067 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SsbP32067 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SsbP32067 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SsbP32067 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SsbP32067 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SsbP32067 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SsbP32067 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SsbP32067 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SsbP32067 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SsbP32067 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SsbP32067 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SsbP32067 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SsbP32067 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SsbP32067 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SsbP32067 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SsbP32067 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SsbP32067 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SsbP32067 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SsbP32067 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SsbP32067 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SsbP32067 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SsbP32067 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SsbP32067 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SsbP32067 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SsbP32067 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SsbP32067 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SsbP32067 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SsbP32067 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SsbP32067 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SsbP32067 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SsbP32067 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SsbP32067 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SsbP32067 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SsbP32067 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SsbP32067 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SsbP32067 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SsbP32067 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SsbP32067 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SsbP32067 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms