Protein–RNA interactions for Protein: P30681

Hmgb2, High mobility group protein B2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgb2P30681 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hmgb2P30681 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hmgb2P30681 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hmgb2P30681 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hmgb2P30681 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hmgb2P30681 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hmgb2P30681 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Hmgb2P30681 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hmgb2P30681 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hmgb2P30681 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hmgb2P30681 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hmgb2P30681 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hmgb2P30681 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hmgb2P30681 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hmgb2P30681 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hmgb2P30681 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hmgb2P30681 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hmgb2P30681 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hmgb2P30681 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hmgb2P30681 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hmgb2P30681 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hmgb2P30681 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hmgb2P30681 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hmgb2P30681 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hmgb2P30681 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hmgb2P30681 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hmgb2P30681 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hmgb2P30681 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hmgb2P30681 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hmgb2P30681 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hmgb2P30681 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hmgb2P30681 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hmgb2P30681 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hmgb2P30681 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hmgb2P30681 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hmgb2P30681 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hmgb2P30681 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hmgb2P30681 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hmgb2P30681 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hmgb2P30681 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hmgb2P30681 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Hmgb2P30681 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hmgb2P30681 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hmgb2P30681 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hmgb2P30681 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hmgb2P30681 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hmgb2P30681 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hmgb2P30681 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Hmgb2P30681 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hmgb2P30681 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hmgb2P30681 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hmgb2P30681 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hmgb2P30681 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hmgb2P30681 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hmgb2P30681 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hmgb2P30681 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hmgb2P30681 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hmgb2P30681 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hmgb2P30681 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Hmgb2P30681 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Hmgb2P30681 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Hmgb2P30681 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Hmgb2P30681 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Hmgb2P30681 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hmgb2P30681 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hmgb2P30681 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hmgb2P30681 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hmgb2P30681 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hmgb2P30681 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hmgb2P30681 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hmgb2P30681 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hmgb2P30681 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hmgb2P30681 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hmgb2P30681 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hmgb2P30681 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hmgb2P30681 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hmgb2P30681 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hmgb2P30681 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hmgb2P30681 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hmgb2P30681 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hmgb2P30681 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hmgb2P30681 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Hmgb2P30681 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hmgb2P30681 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hmgb2P30681 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Hmgb2P30681 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hmgb2P30681 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hmgb2P30681 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hmgb2P30681 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hmgb2P30681 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hmgb2P30681 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hmgb2P30681 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hmgb2P30681 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Hmgb2P30681 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hmgb2P30681 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hmgb2P30681 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hmgb2P30681 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hmgb2P30681 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hmgb2P30681 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hmgb2P30681 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms