Protein–RNA interactions for Protein: P30204

Msr1, Macrophage scavenger receptor types I and II, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msr1P30204 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Msr1P30204 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Msr1P30204 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Msr1P30204 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Msr1P30204 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Msr1P30204 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Msr1P30204 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Msr1P30204 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Msr1P30204 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Msr1P30204 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Msr1P30204 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Msr1P30204 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Msr1P30204 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Msr1P30204 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Msr1P30204 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Msr1P30204 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Msr1P30204 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Msr1P30204 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Msr1P30204 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Msr1P30204 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Msr1P30204 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Msr1P30204 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Msr1P30204 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Msr1P30204 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Msr1P30204 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Msr1P30204 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Msr1P30204 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Msr1P30204 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Msr1P30204 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Msr1P30204 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Msr1P30204 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Msr1P30204 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Msr1P30204 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Msr1P30204 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Msr1P30204 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Msr1P30204 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Msr1P30204 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Msr1P30204 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Msr1P30204 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Msr1P30204 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Msr1P30204 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Msr1P30204 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Msr1P30204 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Msr1P30204 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Msr1P30204 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Msr1P30204 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Msr1P30204 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Msr1P30204 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Msr1P30204 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Msr1P30204 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Msr1P30204 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Msr1P30204 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Msr1P30204 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Msr1P30204 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Msr1P30204 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Msr1P30204 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Msr1P30204 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Msr1P30204 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Msr1P30204 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Msr1P30204 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Msr1P30204 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Msr1P30204 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Msr1P30204 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Msr1P30204 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Msr1P30204 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Msr1P30204 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Msr1P30204 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Msr1P30204 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Msr1P30204 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Msr1P30204 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Msr1P30204 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Msr1P30204 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Msr1P30204 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Msr1P30204 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Msr1P30204 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Msr1P30204 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Msr1P30204 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Msr1P30204 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Msr1P30204 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Msr1P30204 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Msr1P30204 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Msr1P30204 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Msr1P30204 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Msr1P30204 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Msr1P30204 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Msr1P30204 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Msr1P30204 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Msr1P30204 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Msr1P30204 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Msr1P30204 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Msr1P30204 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Msr1P30204 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Msr1P30204 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Msr1P30204 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Msr1P30204 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Msr1P30204 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Msr1P30204 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Msr1P30204 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Msr1P30204 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Msr1P30204 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms