Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PtprmP28828 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PtprmP28828 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PtprmP28828 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PtprmP28828 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PtprmP28828 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
PtprmP28828 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
PtprmP28828 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PtprmP28828 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PtprmP28828 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PtprmP28828 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PtprmP28828 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
PtprmP28828 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PtprmP28828 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PtprmP28828 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PtprmP28828 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PtprmP28828 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PtprmP28828 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PtprmP28828 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PtprmP28828 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
PtprmP28828 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PtprmP28828 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PtprmP28828 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PtprmP28828 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PtprmP28828 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PtprmP28828 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PtprmP28828 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
PtprmP28828 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PtprmP28828 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PtprmP28828 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PtprmP28828 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PtprmP28828 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PtprmP28828 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PtprmP28828 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PtprmP28828 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PtprmP28828 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PtprmP28828 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PtprmP28828 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PtprmP28828 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PtprmP28828 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PtprmP28828 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PtprmP28828 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PtprmP28828 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PtprmP28828 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PtprmP28828 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PtprmP28828 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PtprmP28828 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PtprmP28828 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PtprmP28828 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PtprmP28828 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PtprmP28828 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
PtprmP28828 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PtprmP28828 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
PtprmP28828 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PtprmP28828 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PtprmP28828 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PtprmP28828 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PtprmP28828 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PtprmP28828 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PtprmP28828 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PtprmP28828 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PtprmP28828 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PtprmP28828 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PtprmP28828 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PtprmP28828 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PtprmP28828 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PtprmP28828 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PtprmP28828 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PtprmP28828 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PtprmP28828 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PtprmP28828 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PtprmP28828 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PtprmP28828 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PtprmP28828 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PtprmP28828 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
PtprmP28828 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PtprmP28828 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PtprmP28828 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PtprmP28828 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PtprmP28828 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PtprmP28828 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PtprmP28828 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PtprmP28828 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PtprmP28828 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PtprmP28828 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PtprmP28828 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PtprmP28828 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PtprmP28828 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PtprmP28828 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
PtprmP28828 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PtprmP28828 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PtprmP28828 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
PtprmP28828 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PtprmP28828 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PtprmP28828 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PtprmP28828 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PtprmP28828 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PtprmP28828 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PtprmP28828 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PtprmP28828 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
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