Protein–RNA interactions for Protein: P28231

Gjb3, Gap junction beta-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb3P28231 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Gjb3P28231 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gjb3P28231 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gjb3P28231 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gjb3P28231 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Gjb3P28231 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gjb3P28231 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gjb3P28231 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gjb3P28231 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gjb3P28231 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gjb3P28231 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gjb3P28231 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gjb3P28231 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gjb3P28231 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gjb3P28231 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gjb3P28231 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gjb3P28231 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gjb3P28231 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gjb3P28231 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Gjb3P28231 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gjb3P28231 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gjb3P28231 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gjb3P28231 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gjb3P28231 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gjb3P28231 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gjb3P28231 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gjb3P28231 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gjb3P28231 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gjb3P28231 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gjb3P28231 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gjb3P28231 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gjb3P28231 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gjb3P28231 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gjb3P28231 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gjb3P28231 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gjb3P28231 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gjb3P28231 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gjb3P28231 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gjb3P28231 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gjb3P28231 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gjb3P28231 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gjb3P28231 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gjb3P28231 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gjb3P28231 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gjb3P28231 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gjb3P28231 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gjb3P28231 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gjb3P28231 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gjb3P28231 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gjb3P28231 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gjb3P28231 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gjb3P28231 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gjb3P28231 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gjb3P28231 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gjb3P28231 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gjb3P28231 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Gjb3P28231 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gjb3P28231 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gjb3P28231 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gjb3P28231 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gjb3P28231 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gjb3P28231 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gjb3P28231 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gjb3P28231 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gjb3P28231 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gjb3P28231 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gjb3P28231 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Gjb3P28231 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gjb3P28231 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gjb3P28231 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gjb3P28231 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gjb3P28231 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gjb3P28231 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gjb3P28231 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gjb3P28231 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gjb3P28231 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gjb3P28231 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gjb3P28231 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Gjb3P28231 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gjb3P28231 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gjb3P28231 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Gjb3P28231 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gjb3P28231 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gjb3P28231 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gjb3P28231 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gjb3P28231 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gjb3P28231 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gjb3P28231 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gjb3P28231 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gjb3P28231 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gjb3P28231 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gjb3P28231 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gjb3P28231 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Gjb3P28231 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gjb3P28231 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gjb3P28231 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gjb3P28231 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gjb3P28231 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gjb3P28231 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Gjb3P28231 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms