Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pde6aP27664 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pde6aP27664 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pde6aP27664 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pde6aP27664 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pde6aP27664 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pde6aP27664 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pde6aP27664 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pde6aP27664 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pde6aP27664 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pde6aP27664 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pde6aP27664 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pde6aP27664 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pde6aP27664 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pde6aP27664 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pde6aP27664 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pde6aP27664 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Pde6aP27664 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pde6aP27664 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pde6aP27664 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pde6aP27664 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pde6aP27664 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pde6aP27664 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pde6aP27664 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pde6aP27664 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pde6aP27664 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pde6aP27664 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pde6aP27664 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pde6aP27664 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pde6aP27664 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pde6aP27664 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pde6aP27664 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pde6aP27664 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pde6aP27664 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pde6aP27664 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Pde6aP27664 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pde6aP27664 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pde6aP27664 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pde6aP27664 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pde6aP27664 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pde6aP27664 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Pde6aP27664 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pde6aP27664 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Pde6aP27664 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pde6aP27664 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
Pde6aP27664 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pde6aP27664 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pde6aP27664 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pde6aP27664 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pde6aP27664 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pde6aP27664 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pde6aP27664 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pde6aP27664 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pde6aP27664 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pde6aP27664 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pde6aP27664 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pde6aP27664 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pde6aP27664 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pde6aP27664 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pde6aP27664 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pde6aP27664 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pde6aP27664 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pde6aP27664 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Pde6aP27664 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pde6aP27664 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pde6aP27664 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pde6aP27664 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pde6aP27664 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pde6aP27664 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pde6aP27664 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Pde6aP27664 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pde6aP27664 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pde6aP27664 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pde6aP27664 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pde6aP27664 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pde6aP27664 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pde6aP27664 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pde6aP27664 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pde6aP27664 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pde6aP27664 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pde6aP27664 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pde6aP27664 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pde6aP27664 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pde6aP27664 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pde6aP27664 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pde6aP27664 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pde6aP27664 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Pde6aP27664 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pde6aP27664 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pde6aP27664 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pde6aP27664 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pde6aP27664 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pde6aP27664 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pde6aP27664 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pde6aP27664 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pde6aP27664 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pde6aP27664 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pde6aP27664 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Pde6aP27664 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pde6aP27664 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms