Protein–RNA interactions for Protein: P23950

Zfp36l1, mRNA decay activator protein ZFP36L1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp36l1P23950 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp36l1P23950 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp36l1P23950 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp36l1P23950 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp36l1P23950 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp36l1P23950 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp36l1P23950 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp36l1P23950 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp36l1P23950 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp36l1P23950 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp36l1P23950 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp36l1P23950 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Zfp36l1P23950 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Zfp36l1P23950 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp36l1P23950 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp36l1P23950 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp36l1P23950 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp36l1P23950 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp36l1P23950 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp36l1P23950 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp36l1P23950 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp36l1P23950 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp36l1P23950 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp36l1P23950 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp36l1P23950 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp36l1P23950 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp36l1P23950 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp36l1P23950 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp36l1P23950 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp36l1P23950 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp36l1P23950 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp36l1P23950 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp36l1P23950 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp36l1P23950 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp36l1P23950 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp36l1P23950 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp36l1P23950 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp36l1P23950 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp36l1P23950 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp36l1P23950 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp36l1P23950 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp36l1P23950 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp36l1P23950 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp36l1P23950 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp36l1P23950 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp36l1P23950 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp36l1P23950 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp36l1P23950 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp36l1P23950 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp36l1P23950 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp36l1P23950 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp36l1P23950 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp36l1P23950 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp36l1P23950 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp36l1P23950 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp36l1P23950 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp36l1P23950 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp36l1P23950 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp36l1P23950 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp36l1P23950 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp36l1P23950 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp36l1P23950 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp36l1P23950 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp36l1P23950 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp36l1P23950 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp36l1P23950 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp36l1P23950 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp36l1P23950 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp36l1P23950 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp36l1P23950 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp36l1P23950 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp36l1P23950 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp36l1P23950 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp36l1P23950 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp36l1P23950 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp36l1P23950 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp36l1P23950 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp36l1P23950 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp36l1P23950 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp36l1P23950 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp36l1P23950 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp36l1P23950 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp36l1P23950 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp36l1P23950 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp36l1P23950 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp36l1P23950 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp36l1P23950 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp36l1P23950 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp36l1P23950 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp36l1P23950 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp36l1P23950 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp36l1P23950 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp36l1P23950 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp36l1P23950 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp36l1P23950 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp36l1P23950 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp36l1P23950 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp36l1P23950 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp36l1P23950 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp36l1P23950 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms