Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RarbP22605 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RarbP22605 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RarbP22605 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RarbP22605 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RarbP22605 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RarbP22605 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RarbP22605 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RarbP22605 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RarbP22605 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RarbP22605 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RarbP22605 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RarbP22605 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RarbP22605 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RarbP22605 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RarbP22605 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RarbP22605 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RarbP22605 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RarbP22605 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RarbP22605 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RarbP22605 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RarbP22605 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RarbP22605 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RarbP22605 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RarbP22605 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RarbP22605 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RarbP22605 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RarbP22605 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RarbP22605 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RarbP22605 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RarbP22605 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RarbP22605 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RarbP22605 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RarbP22605 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RarbP22605 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RarbP22605 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RarbP22605 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RarbP22605 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RarbP22605 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RarbP22605 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RarbP22605 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RarbP22605 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RarbP22605 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RarbP22605 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RarbP22605 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RarbP22605 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RarbP22605 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RarbP22605 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RarbP22605 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RarbP22605 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RarbP22605 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RarbP22605 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RarbP22605 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RarbP22605 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RarbP22605 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RarbP22605 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RarbP22605 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RarbP22605 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RarbP22605 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RarbP22605 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RarbP22605 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RarbP22605 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RarbP22605 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RarbP22605 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RarbP22605 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RarbP22605 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RarbP22605 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RarbP22605 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RarbP22605 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RarbP22605 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RarbP22605 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RarbP22605 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RarbP22605 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RarbP22605 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RarbP22605 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RarbP22605 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RarbP22605 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RarbP22605 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RarbP22605 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RarbP22605 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RarbP22605 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RarbP22605 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RarbP22605 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RarbP22605 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RarbP22605 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RarbP22605 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RarbP22605 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RarbP22605 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RarbP22605 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RarbP22605 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RarbP22605 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RarbP22605 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RarbP22605 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RarbP22605 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RarbP22605 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RarbP22605 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RarbP22605 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RarbP22605 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RarbP22605 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RarbP22605 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms