Protein–RNA interactions for Protein: P21440

Abcb4, Phosphatidylcholine translocator ABCB4, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb4P21440 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Abcb4P21440 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Abcb4P21440 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Abcb4P21440 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Abcb4P21440 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Abcb4P21440 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Abcb4P21440 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Abcb4P21440 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Abcb4P21440 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Abcb4P21440 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Abcb4P21440 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Abcb4P21440 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Abcb4P21440 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Abcb4P21440 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Abcb4P21440 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Abcb4P21440 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Abcb4P21440 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Abcb4P21440 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Abcb4P21440 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Abcb4P21440 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Abcb4P21440 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Abcb4P21440 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Abcb4P21440 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Abcb4P21440 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Abcb4P21440 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Abcb4P21440 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Abcb4P21440 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Abcb4P21440 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Abcb4P21440 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Abcb4P21440 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Abcb4P21440 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Abcb4P21440 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Abcb4P21440 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Abcb4P21440 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Abcb4P21440 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Abcb4P21440 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Abcb4P21440 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Abcb4P21440 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Abcb4P21440 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Abcb4P21440 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Abcb4P21440 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Abcb4P21440 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Abcb4P21440 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Abcb4P21440 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Abcb4P21440 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Abcb4P21440 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Abcb4P21440 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Abcb4P21440 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Abcb4P21440 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Abcb4P21440 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Abcb4P21440 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Abcb4P21440 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Abcb4P21440 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Abcb4P21440 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Abcb4P21440 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Abcb4P21440 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Abcb4P21440 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Abcb4P21440 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Abcb4P21440 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Abcb4P21440 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Abcb4P21440 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Abcb4P21440 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Abcb4P21440 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Abcb4P21440 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Abcb4P21440 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Abcb4P21440 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Abcb4P21440 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Abcb4P21440 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Abcb4P21440 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Abcb4P21440 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Abcb4P21440 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Abcb4P21440 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Abcb4P21440 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Abcb4P21440 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Abcb4P21440 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Abcb4P21440 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Abcb4P21440 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Abcb4P21440 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.31■■□□□ 1
Abcb4P21440 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Abcb4P21440 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Abcb4P21440 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Abcb4P21440 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Abcb4P21440 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Abcb4P21440 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Abcb4P21440 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Abcb4P21440 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Abcb4P21440 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Abcb4P21440 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Abcb4P21440 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Abcb4P21440 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Abcb4P21440 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Abcb4P21440 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Abcb4P21440 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Abcb4P21440 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Abcb4P21440 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Abcb4P21440 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Abcb4P21440 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Abcb4P21440 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Abcb4P21440 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.29■■□□□ 1
Abcb4P21440 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms