Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PrkcaP20444 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PrkcaP20444 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PrkcaP20444 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PrkcaP20444 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PrkcaP20444 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PrkcaP20444 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PrkcaP20444 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PrkcaP20444 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PrkcaP20444 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PrkcaP20444 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PrkcaP20444 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PrkcaP20444 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PrkcaP20444 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PrkcaP20444 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PrkcaP20444 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PrkcaP20444 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PrkcaP20444 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PrkcaP20444 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PrkcaP20444 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PrkcaP20444 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PrkcaP20444 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PrkcaP20444 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PrkcaP20444 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PrkcaP20444 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PrkcaP20444 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PrkcaP20444 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PrkcaP20444 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PrkcaP20444 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PrkcaP20444 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
PrkcaP20444 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PrkcaP20444 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PrkcaP20444 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PrkcaP20444 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PrkcaP20444 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PrkcaP20444 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PrkcaP20444 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PrkcaP20444 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PrkcaP20444 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PrkcaP20444 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PrkcaP20444 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PrkcaP20444 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PrkcaP20444 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PrkcaP20444 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PrkcaP20444 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PrkcaP20444 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PrkcaP20444 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PrkcaP20444 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PrkcaP20444 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PrkcaP20444 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PrkcaP20444 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PrkcaP20444 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PrkcaP20444 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PrkcaP20444 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PrkcaP20444 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PrkcaP20444 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PrkcaP20444 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PrkcaP20444 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PrkcaP20444 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PrkcaP20444 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PrkcaP20444 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PrkcaP20444 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PrkcaP20444 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PrkcaP20444 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PrkcaP20444 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PrkcaP20444 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PrkcaP20444 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PrkcaP20444 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PrkcaP20444 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PrkcaP20444 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PrkcaP20444 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PrkcaP20444 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PrkcaP20444 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PrkcaP20444 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PrkcaP20444 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PrkcaP20444 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PrkcaP20444 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PrkcaP20444 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PrkcaP20444 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PrkcaP20444 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PrkcaP20444 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PrkcaP20444 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PrkcaP20444 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PrkcaP20444 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PrkcaP20444 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PrkcaP20444 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PrkcaP20444 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PrkcaP20444 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PrkcaP20444 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PrkcaP20444 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PrkcaP20444 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PrkcaP20444 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PrkcaP20444 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PrkcaP20444 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PrkcaP20444 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PrkcaP20444 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PrkcaP20444 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PrkcaP20444 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PrkcaP20444 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PrkcaP20444 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms