Protein–RNA interactions for Protein: P20443

Sag, S-arrestin, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SagP20443 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SagP20443 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SagP20443 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SagP20443 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SagP20443 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SagP20443 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SagP20443 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SagP20443 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SagP20443 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SagP20443 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SagP20443 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SagP20443 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SagP20443 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SagP20443 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SagP20443 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SagP20443 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SagP20443 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SagP20443 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SagP20443 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SagP20443 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SagP20443 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SagP20443 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SagP20443 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SagP20443 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SagP20443 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SagP20443 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SagP20443 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SagP20443 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SagP20443 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SagP20443 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SagP20443 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SagP20443 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SagP20443 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SagP20443 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SagP20443 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SagP20443 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SagP20443 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SagP20443 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SagP20443 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SagP20443 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SagP20443 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SagP20443 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SagP20443 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SagP20443 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SagP20443 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SagP20443 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SagP20443 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SagP20443 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SagP20443 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SagP20443 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SagP20443 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SagP20443 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SagP20443 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SagP20443 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SagP20443 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SagP20443 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SagP20443 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SagP20443 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SagP20443 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SagP20443 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SagP20443 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SagP20443 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SagP20443 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SagP20443 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SagP20443 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SagP20443 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SagP20443 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SagP20443 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SagP20443 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SagP20443 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SagP20443 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SagP20443 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SagP20443 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SagP20443 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SagP20443 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SagP20443 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SagP20443 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SagP20443 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SagP20443 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SagP20443 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SagP20443 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SagP20443 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SagP20443 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SagP20443 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SagP20443 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SagP20443 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SagP20443 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SagP20443 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SagP20443 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SagP20443 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SagP20443 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SagP20443 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SagP20443 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SagP20443 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SagP20443 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SagP20443 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SagP20443 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SagP20443 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SagP20443 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SagP20443 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms