Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NefhP19246 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NefhP19246 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NefhP19246 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NefhP19246 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NefhP19246 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NefhP19246 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NefhP19246 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NefhP19246 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NefhP19246 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NefhP19246 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NefhP19246 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NefhP19246 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NefhP19246 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NefhP19246 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NefhP19246 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NefhP19246 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NefhP19246 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NefhP19246 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NefhP19246 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NefhP19246 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NefhP19246 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NefhP19246 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NefhP19246 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NefhP19246 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NefhP19246 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NefhP19246 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NefhP19246 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NefhP19246 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NefhP19246 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NefhP19246 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NefhP19246 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NefhP19246 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NefhP19246 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NefhP19246 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NefhP19246 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NefhP19246 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NefhP19246 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NefhP19246 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NefhP19246 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NefhP19246 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NefhP19246 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NefhP19246 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NefhP19246 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NefhP19246 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NefhP19246 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NefhP19246 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NefhP19246 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NefhP19246 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NefhP19246 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NefhP19246 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NefhP19246 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NefhP19246 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NefhP19246 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NefhP19246 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NefhP19246 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NefhP19246 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NefhP19246 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NefhP19246 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NefhP19246 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NefhP19246 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NefhP19246 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NefhP19246 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NefhP19246 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NefhP19246 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NefhP19246 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NefhP19246 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NefhP19246 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NefhP19246 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NefhP19246 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NefhP19246 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NefhP19246 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NefhP19246 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NefhP19246 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NefhP19246 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NefhP19246 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NefhP19246 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NefhP19246 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NefhP19246 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NefhP19246 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NefhP19246 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NefhP19246 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NefhP19246 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NefhP19246 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NefhP19246 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NefhP19246 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NefhP19246 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NefhP19246 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NefhP19246 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NefhP19246 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NefhP19246 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NefhP19246 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NefhP19246 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NefhP19246 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NefhP19246 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NefhP19246 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NefhP19246 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NefhP19246 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NefhP19246 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NefhP19246 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms