Protein–RNA interactions for Protein: P19228

Csn1s1, Alpha-S1-casein, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csn1s1P19228 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Csn1s1P19228 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Csn1s1P19228 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Csn1s1P19228 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Csn1s1P19228 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Csn1s1P19228 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Csn1s1P19228 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Csn1s1P19228 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Csn1s1P19228 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Csn1s1P19228 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Csn1s1P19228 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Csn1s1P19228 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Csn1s1P19228 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Csn1s1P19228 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Csn1s1P19228 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Csn1s1P19228 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Csn1s1P19228 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Csn1s1P19228 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Csn1s1P19228 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Csn1s1P19228 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Csn1s1P19228 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Csn1s1P19228 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Csn1s1P19228 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Csn1s1P19228 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Csn1s1P19228 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Csn1s1P19228 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Csn1s1P19228 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Csn1s1P19228 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Csn1s1P19228 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Csn1s1P19228 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Csn1s1P19228 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Csn1s1P19228 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Csn1s1P19228 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Csn1s1P19228 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Csn1s1P19228 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Csn1s1P19228 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Csn1s1P19228 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Csn1s1P19228 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Csn1s1P19228 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Csn1s1P19228 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Csn1s1P19228 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Csn1s1P19228 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Csn1s1P19228 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Csn1s1P19228 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Csn1s1P19228 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Csn1s1P19228 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Csn1s1P19228 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Csn1s1P19228 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Csn1s1P19228 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Csn1s1P19228 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Csn1s1P19228 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Csn1s1P19228 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Csn1s1P19228 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Csn1s1P19228 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Csn1s1P19228 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Csn1s1P19228 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Csn1s1P19228 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Csn1s1P19228 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Csn1s1P19228 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Csn1s1P19228 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Csn1s1P19228 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Csn1s1P19228 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Csn1s1P19228 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Csn1s1P19228 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Csn1s1P19228 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Csn1s1P19228 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Csn1s1P19228 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Csn1s1P19228 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Csn1s1P19228 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Csn1s1P19228 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Csn1s1P19228 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Csn1s1P19228 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Csn1s1P19228 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Csn1s1P19228 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Csn1s1P19228 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Csn1s1P19228 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Csn1s1P19228 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Csn1s1P19228 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Csn1s1P19228 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Csn1s1P19228 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Csn1s1P19228 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Csn1s1P19228 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Csn1s1P19228 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Csn1s1P19228 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Csn1s1P19228 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Csn1s1P19228 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Csn1s1P19228 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Csn1s1P19228 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Csn1s1P19228 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Csn1s1P19228 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Csn1s1P19228 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Csn1s1P19228 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Csn1s1P19228 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Csn1s1P19228 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Csn1s1P19228 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Csn1s1P19228 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Csn1s1P19228 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Csn1s1P19228 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Csn1s1P19228 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Csn1s1P19228 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms