Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pou4f1P17208 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pou4f1P17208 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pou4f1P17208 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pou4f1P17208 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pou4f1P17208 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pou4f1P17208 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pou4f1P17208 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pou4f1P17208 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pou4f1P17208 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Pou4f1P17208 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pou4f1P17208 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pou4f1P17208 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pou4f1P17208 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pou4f1P17208 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pou4f1P17208 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pou4f1P17208 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pou4f1P17208 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pou4f1P17208 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pou4f1P17208 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pou4f1P17208 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pou4f1P17208 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pou4f1P17208 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Pou4f1P17208 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Pou4f1P17208 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pou4f1P17208 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pou4f1P17208 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Pou4f1P17208 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pou4f1P17208 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pou4f1P17208 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pou4f1P17208 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pou4f1P17208 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pou4f1P17208 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Pou4f1P17208 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pou4f1P17208 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pou4f1P17208 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pou4f1P17208 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pou4f1P17208 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pou4f1P17208 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pou4f1P17208 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pou4f1P17208 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pou4f1P17208 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pou4f1P17208 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pou4f1P17208 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pou4f1P17208 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pou4f1P17208 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pou4f1P17208 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pou4f1P17208 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pou4f1P17208 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pou4f1P17208 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pou4f1P17208 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pou4f1P17208 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pou4f1P17208 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pou4f1P17208 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pou4f1P17208 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pou4f1P17208 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pou4f1P17208 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pou4f1P17208 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pou4f1P17208 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pou4f1P17208 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pou4f1P17208 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pou4f1P17208 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pou4f1P17208 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pou4f1P17208 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pou4f1P17208 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pou4f1P17208 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pou4f1P17208 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pou4f1P17208 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pou4f1P17208 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pou4f1P17208 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pou4f1P17208 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pou4f1P17208 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pou4f1P17208 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pou4f1P17208 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pou4f1P17208 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pou4f1P17208 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pou4f1P17208 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pou4f1P17208 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pou4f1P17208 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pou4f1P17208 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pou4f1P17208 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pou4f1P17208 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pou4f1P17208 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pou4f1P17208 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pou4f1P17208 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pou4f1P17208 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pou4f1P17208 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Pou4f1P17208 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pou4f1P17208 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pou4f1P17208 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pou4f1P17208 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pou4f1P17208 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pou4f1P17208 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pou4f1P17208 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pou4f1P17208 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pou4f1P17208 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Pou4f1P17208 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pou4f1P17208 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pou4f1P17208 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pou4f1P17208 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms