Protein–RNA interactions for Protein: P16054

Prkce, Protein kinase C epsilon type, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkceP16054 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PrkceP16054 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PrkceP16054 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PrkceP16054 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PrkceP16054 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PrkceP16054 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PrkceP16054 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PrkceP16054 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
PrkceP16054 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PrkceP16054 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PrkceP16054 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PrkceP16054 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PrkceP16054 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PrkceP16054 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PrkceP16054 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PrkceP16054 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PrkceP16054 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PrkceP16054 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PrkceP16054 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PrkceP16054 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PrkceP16054 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PrkceP16054 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PrkceP16054 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PrkceP16054 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PrkceP16054 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PrkceP16054 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PrkceP16054 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PrkceP16054 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PrkceP16054 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PrkceP16054 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PrkceP16054 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PrkceP16054 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PrkceP16054 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PrkceP16054 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PrkceP16054 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PrkceP16054 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PrkceP16054 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PrkceP16054 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PrkceP16054 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PrkceP16054 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PrkceP16054 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PrkceP16054 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PrkceP16054 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PrkceP16054 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PrkceP16054 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PrkceP16054 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PrkceP16054 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PrkceP16054 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PrkceP16054 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PrkceP16054 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PrkceP16054 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PrkceP16054 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PrkceP16054 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PrkceP16054 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PrkceP16054 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PrkceP16054 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PrkceP16054 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PrkceP16054 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PrkceP16054 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PrkceP16054 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PrkceP16054 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PrkceP16054 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PrkceP16054 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PrkceP16054 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PrkceP16054 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
PrkceP16054 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PrkceP16054 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PrkceP16054 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PrkceP16054 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PrkceP16054 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PrkceP16054 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PrkceP16054 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PrkceP16054 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PrkceP16054 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PrkceP16054 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PrkceP16054 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PrkceP16054 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PrkceP16054 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PrkceP16054 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PrkceP16054 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PrkceP16054 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PrkceP16054 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PrkceP16054 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PrkceP16054 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PrkceP16054 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PrkceP16054 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PrkceP16054 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PrkceP16054 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PrkceP16054 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PrkceP16054 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PrkceP16054 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PrkceP16054 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PrkceP16054 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PrkceP16054 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PrkceP16054 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PrkceP16054 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PrkceP16054 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PrkceP16054 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PrkceP16054 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PrkceP16054 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms