Protein–RNA interactions for Protein: P15379

Cd44, CD44 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd44P15379 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cd44P15379 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cd44P15379 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cd44P15379 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cd44P15379 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cd44P15379 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cd44P15379 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cd44P15379 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cd44P15379 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cd44P15379 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Cd44P15379 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cd44P15379 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cd44P15379 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cd44P15379 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cd44P15379 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cd44P15379 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cd44P15379 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cd44P15379 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cd44P15379 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cd44P15379 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cd44P15379 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cd44P15379 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Cd44P15379 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cd44P15379 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cd44P15379 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cd44P15379 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cd44P15379 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cd44P15379 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cd44P15379 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Cd44P15379 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cd44P15379 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Cd44P15379 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cd44P15379 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cd44P15379 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cd44P15379 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cd44P15379 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cd44P15379 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cd44P15379 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cd44P15379 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cd44P15379 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cd44P15379 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Cd44P15379 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cd44P15379 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cd44P15379 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Cd44P15379 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cd44P15379 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cd44P15379 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cd44P15379 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cd44P15379 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd44P15379 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd44P15379 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd44P15379 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd44P15379 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd44P15379 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd44P15379 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd44P15379 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd44P15379 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd44P15379 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd44P15379 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd44P15379 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd44P15379 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd44P15379 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd44P15379 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd44P15379 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cd44P15379 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cd44P15379 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cd44P15379 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cd44P15379 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cd44P15379 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cd44P15379 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cd44P15379 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd44P15379 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd44P15379 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd44P15379 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd44P15379 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd44P15379 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd44P15379 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd44P15379 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd44P15379 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd44P15379 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd44P15379 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd44P15379 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd44P15379 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd44P15379 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd44P15379 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd44P15379 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd44P15379 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd44P15379 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd44P15379 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd44P15379 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd44P15379 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd44P15379 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd44P15379 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd44P15379 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd44P15379 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd44P15379 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd44P15379 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd44P15379 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd44P15379 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cd44P15379 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms