Protein–RNA interactions for Protein: P13864

Dnmt1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt1P13864 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Dnmt1P13864 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
Dnmt1P13864 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Dnmt1P13864 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Dnmt1P13864 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Dnmt1P13864 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
Dnmt1P13864 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Dnmt1P13864 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Dnmt1P13864 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Dnmt1P13864 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Dnmt1P13864 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Dnmt1P13864 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Dnmt1P13864 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Dnmt1P13864 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Dnmt1P13864 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Dnmt1P13864 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Dnmt1P13864 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Dnmt1P13864 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Dnmt1P13864 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Dnmt1P13864 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Dnmt1P13864 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Dnmt1P13864 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Dnmt1P13864 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Dnmt1P13864 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Dnmt1P13864 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
Dnmt1P13864 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Dnmt1P13864 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Dnmt1P13864 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Dnmt1P13864 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Dnmt1P13864 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Dnmt1P13864 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Dnmt1P13864 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Dnmt1P13864 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Dnmt1P13864 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Dnmt1P13864 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Dnmt1P13864 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Dnmt1P13864 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Dnmt1P13864 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Dnmt1P13864 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
Dnmt1P13864 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Dnmt1P13864 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Dnmt1P13864 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Dnmt1P13864 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Dnmt1P13864 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
Dnmt1P13864 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Dnmt1P13864 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Dnmt1P13864 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Dnmt1P13864 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Dnmt1P13864 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Dnmt1P13864 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Dnmt1P13864 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Dnmt1P13864 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Dnmt1P13864 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Dnmt1P13864 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Dnmt1P13864 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Dnmt1P13864 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Dnmt1P13864 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Dnmt1P13864 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Dnmt1P13864 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Dnmt1P13864 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Dnmt1P13864 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Dnmt1P13864 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Dnmt1P13864 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Dnmt1P13864 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Dnmt1P13864 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Dnmt1P13864 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Dnmt1P13864 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Dnmt1P13864 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Dnmt1P13864 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Dnmt1P13864 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
Dnmt1P13864 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
Dnmt1P13864 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
Dnmt1P13864 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Dnmt1P13864 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Dnmt1P13864 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Dnmt1P13864 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Dnmt1P13864 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Dnmt1P13864 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Dnmt1P13864 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Dnmt1P13864 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
Dnmt1P13864 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Dnmt1P13864 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Dnmt1P13864 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Dnmt1P13864 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
Dnmt1P13864 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Dnmt1P13864 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Dnmt1P13864 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
Dnmt1P13864 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Dnmt1P13864 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Dnmt1P13864 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Dnmt1P13864 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Dnmt1P13864 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Dnmt1P13864 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Dnmt1P13864 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Dnmt1P13864 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Dnmt1P13864 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Dnmt1P13864 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Dnmt1P13864 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Dnmt1P13864 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Dnmt1P13864 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms