Protein–RNA interactions for Protein: P11477

Defa1, Alpha-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa1P11477 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Defa1P11477 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Defa1P11477 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Defa1P11477 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Defa1P11477 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Defa1P11477 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Defa1P11477 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Defa1P11477 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Defa1P11477 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Defa1P11477 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Defa1P11477 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Defa1P11477 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Defa1P11477 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Defa1P11477 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Defa1P11477 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Defa1P11477 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Defa1P11477 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Defa1P11477 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Defa1P11477 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Defa1P11477 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Defa1P11477 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Defa1P11477 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Defa1P11477 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Defa1P11477 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Defa1P11477 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Defa1P11477 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Defa1P11477 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Defa1P11477 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Defa1P11477 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Defa1P11477 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Defa1P11477 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Defa1P11477 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Defa1P11477 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Defa1P11477 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Defa1P11477 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Defa1P11477 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Defa1P11477 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Defa1P11477 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Defa1P11477 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Defa1P11477 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Defa1P11477 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Defa1P11477 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Defa1P11477 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Defa1P11477 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Defa1P11477 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Defa1P11477 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Defa1P11477 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Defa1P11477 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Defa1P11477 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Defa1P11477 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Defa1P11477 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Defa1P11477 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Defa1P11477 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Defa1P11477 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Defa1P11477 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Defa1P11477 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Defa1P11477 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Defa1P11477 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Defa1P11477 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Defa1P11477 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Defa1P11477 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Defa1P11477 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Defa1P11477 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Defa1P11477 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Defa1P11477 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Defa1P11477 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Defa1P11477 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Defa1P11477 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Defa1P11477 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Defa1P11477 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Defa1P11477 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Defa1P11477 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Defa1P11477 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Defa1P11477 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Defa1P11477 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Defa1P11477 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Defa1P11477 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Defa1P11477 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Defa1P11477 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Defa1P11477 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Defa1P11477 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Defa1P11477 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Defa1P11477 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Defa1P11477 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Defa1P11477 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Defa1P11477 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Defa1P11477 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Defa1P11477 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Defa1P11477 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Defa1P11477 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Defa1P11477 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Defa1P11477 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Defa1P11477 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Defa1P11477 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Defa1P11477 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Defa1P11477 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Defa1P11477 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Defa1P11477 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Defa1P11477 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Defa1P11477 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms