Protein–RNA interactions for Protein: P09235

Ifna9, Interferon alpha-9, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna9P09235 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifna9P09235 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifna9P09235 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifna9P09235 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifna9P09235 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifna9P09235 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifna9P09235 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifna9P09235 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifna9P09235 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifna9P09235 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifna9P09235 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifna9P09235 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifna9P09235 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifna9P09235 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifna9P09235 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifna9P09235 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifna9P09235 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifna9P09235 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifna9P09235 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifna9P09235 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifna9P09235 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifna9P09235 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifna9P09235 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifna9P09235 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifna9P09235 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifna9P09235 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifna9P09235 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifna9P09235 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifna9P09235 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifna9P09235 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifna9P09235 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifna9P09235 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifna9P09235 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifna9P09235 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifna9P09235 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifna9P09235 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifna9P09235 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifna9P09235 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifna9P09235 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifna9P09235 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifna9P09235 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifna9P09235 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifna9P09235 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifna9P09235 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifna9P09235 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifna9P09235 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifna9P09235 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifna9P09235 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifna9P09235 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifna9P09235 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifna9P09235 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifna9P09235 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifna9P09235 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifna9P09235 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifna9P09235 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifna9P09235 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifna9P09235 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifna9P09235 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifna9P09235 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifna9P09235 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifna9P09235 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifna9P09235 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifna9P09235 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifna9P09235 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifna9P09235 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifna9P09235 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifna9P09235 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifna9P09235 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifna9P09235 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifna9P09235 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifna9P09235 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifna9P09235 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifna9P09235 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifna9P09235 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifna9P09235 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifna9P09235 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifna9P09235 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifna9P09235 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifna9P09235 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifna9P09235 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifna9P09235 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifna9P09235 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifna9P09235 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifna9P09235 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifna9P09235 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifna9P09235 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifna9P09235 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifna9P09235 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ifna9P09235 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ifna9P09235 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ifna9P09235 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ifna9P09235 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ifna9P09235 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ifna9P09235 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ifna9P09235 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ifna9P09235 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ifna9P09235 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ifna9P09235 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ifna9P09235 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ifna9P09235 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms