Protein–RNA interactions for Protein: P08121

Col3a1, Collagen alpha-1(III) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col3a1P08121 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col3a1P08121 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col3a1P08121 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Col3a1P08121 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Col3a1P08121 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Col3a1P08121 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Col3a1P08121 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Col3a1P08121 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Col3a1P08121 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Col3a1P08121 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Col3a1P08121 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Col3a1P08121 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Col3a1P08121 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Col3a1P08121 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Col3a1P08121 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Col3a1P08121 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Col3a1P08121 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Col3a1P08121 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Col3a1P08121 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Col3a1P08121 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Col3a1P08121 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Col3a1P08121 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Col3a1P08121 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Col3a1P08121 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Col3a1P08121 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Col3a1P08121 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Col3a1P08121 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Col3a1P08121 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Col3a1P08121 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Col3a1P08121 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Col3a1P08121 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Col3a1P08121 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Col3a1P08121 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Col3a1P08121 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Col3a1P08121 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Col3a1P08121 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Col3a1P08121 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Col3a1P08121 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Col3a1P08121 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Col3a1P08121 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Col3a1P08121 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Col3a1P08121 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Col3a1P08121 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Col3a1P08121 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Col3a1P08121 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Col3a1P08121 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Col3a1P08121 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Col3a1P08121 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Col3a1P08121 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Col3a1P08121 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Col3a1P08121 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Col3a1P08121 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Col3a1P08121 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Col3a1P08121 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Col3a1P08121 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Col3a1P08121 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Col3a1P08121 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Col3a1P08121 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Col3a1P08121 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Col3a1P08121 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Col3a1P08121 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Col3a1P08121 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Col3a1P08121 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Col3a1P08121 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Col3a1P08121 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Col3a1P08121 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Col3a1P08121 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Col3a1P08121 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Col3a1P08121 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Col3a1P08121 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Col3a1P08121 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Col3a1P08121 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Col3a1P08121 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Col3a1P08121 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Col3a1P08121 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Col3a1P08121 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Col3a1P08121 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Col3a1P08121 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Col3a1P08121 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Col3a1P08121 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Col3a1P08121 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Col3a1P08121 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Col3a1P08121 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Col3a1P08121 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Col3a1P08121 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Col3a1P08121 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Col3a1P08121 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Col3a1P08121 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Col3a1P08121 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Col3a1P08121 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Col3a1P08121 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Col3a1P08121 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Col3a1P08121 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Col3a1P08121 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Col3a1P08121 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Col3a1P08121 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Col3a1P08121 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Col3a1P08121 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Col3a1P08121 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Col3a1P08121 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms