Protein–RNA interactions for Protein: P07350

Ifna6, Interferon alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna6P07350 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifna6P07350 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifna6P07350 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifna6P07350 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifna6P07350 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifna6P07350 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifna6P07350 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifna6P07350 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifna6P07350 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifna6P07350 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifna6P07350 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifna6P07350 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifna6P07350 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifna6P07350 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifna6P07350 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifna6P07350 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifna6P07350 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifna6P07350 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifna6P07350 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifna6P07350 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifna6P07350 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifna6P07350 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifna6P07350 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifna6P07350 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifna6P07350 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifna6P07350 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifna6P07350 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifna6P07350 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifna6P07350 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifna6P07350 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifna6P07350 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifna6P07350 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifna6P07350 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifna6P07350 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifna6P07350 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifna6P07350 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifna6P07350 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifna6P07350 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifna6P07350 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifna6P07350 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifna6P07350 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifna6P07350 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifna6P07350 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifna6P07350 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifna6P07350 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifna6P07350 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifna6P07350 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifna6P07350 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifna6P07350 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifna6P07350 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifna6P07350 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifna6P07350 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifna6P07350 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifna6P07350 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifna6P07350 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifna6P07350 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifna6P07350 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifna6P07350 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifna6P07350 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifna6P07350 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifna6P07350 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifna6P07350 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifna6P07350 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifna6P07350 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifna6P07350 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifna6P07350 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifna6P07350 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifna6P07350 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifna6P07350 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifna6P07350 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifna6P07350 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifna6P07350 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifna6P07350 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifna6P07350 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifna6P07350 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifna6P07350 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifna6P07350 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifna6P07350 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifna6P07350 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifna6P07350 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifna6P07350 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifna6P07350 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifna6P07350 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifna6P07350 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifna6P07350 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifna6P07350 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifna6P07350 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifna6P07350 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifna6P07350 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifna6P07350 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifna6P07350 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifna6P07350 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifna6P07350 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifna6P07350 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifna6P07350 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifna6P07350 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifna6P07350 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifna6P07350 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ifna6P07350 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ifna6P07350 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms